RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 CA8P35219 290 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 KRT20P35900 424 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ATP6V1E1P36543 226 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 SP140Q13342 867 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 LAPTM5Q13571 262 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 BOLA3Q53S33 107 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 CEP135Q66GS9 1140 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 NLRP14Q86W24 1093 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 LRRC45Q96CN5 670 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 HIC2Q96JB3 615 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 SH3GL3Q99963 347 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 KLK14Q9P0G3 267 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 BCS1LQ9Y276 419 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 KIF1BO60333 1816 aa6.15□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 ADGRB3O60242 1522 aa6.15□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 H0YC42 278 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 ERLIN1O75477 346 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 PAHP00439 452 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 NFKB1P19838 968 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 TMOD1P28289 359 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 S100A5P33763 92 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 HOXD12P35452 270 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 MTHFRP42898 656 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 RPS6KA3P51812 740 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 GTF2A2P52657 109 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 RARSP54136 660 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 DAB2P98082 770 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 CCINQ13939 588 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 RABEP1Q15276 862 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 HIF1AQ16665 826 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 NXNQ6DKJ4 435 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 WDR63Q8IWG1 891 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 CEP57L1Q8IYX8 460 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 ABTB2Q8N961 1025 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 PJA1Q8NG27 643 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 ERMNQ8TAM6 284 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 PANK1Q8TE04 598 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 STON2Q8WXE9 905 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 NACC1Q96RE7 527 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 CDH19Q9H159 772 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM260Q9NX78 707 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 WDR35Q9P2L0 1181 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 NSD3Q9BZ95 1437 aa6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms