RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559494.1

TSPAN3-207, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN3, Length 1,326 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-207ENST00000559494 PSMD10O75832 226 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN3-207ENST00000559494 MFSD10Q14728 455 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN3-207ENST00000559494 TRIM50Q86XT4 487 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN3-207ENST00000559494 TOX2Q96NM4 488 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN3-207ENST00000559494 PCYT2Q99447 389 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN3-207ENST00000559494 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN3-207ENST00000559494 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN3-207ENST00000559494 H3BRB1 525 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 HAS1Q92839 578 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 GAS7O60861 476 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 LGR5O75473 907 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 PDCP20941 246 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 SYT1P21579 422 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 FAAP100Q0VG06 881 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 POTEDQ86YR6 584 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 FAM20AQ96MK3 541 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 TBX3O15119 743 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 CD4P01730 458 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 KRT76Q01546 638 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF174Q15697 407 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 TRAPPC10P48553 1259 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 SESTD1Q86VW0 696 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 B4GALT4O60513 344 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 MCM7P33993 719 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 STAT5BP51692 787 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 NBR1Q14596 966 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 TTC38Q5R3I4 469 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 GLG1Q92896 1179 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 MTMR9Q96QG7 549 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 EMSYQ7Z589 1322 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 H0YGN5 161 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 MARCH6O60337 910 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 NEMFO60524 1076 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 CLTBP09497 229 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 SYN1P17600 705 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 HIC1Q14526 733 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 C7orf31Q8N865 590 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 AZI2Q9H6S1 392 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 DISC1Q9NRI5 854 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 VAV3Q9UKW4 847 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 KAT6AQ92794 2004 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 CHMP2AO43633 222 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 MARK3P27448 753 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 CALCRLQ16602 461 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 MTMR6Q9Y217 621 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN3-207ENST00000559494 WDR64B1ANS9 1081 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN3-207ENST00000559494 EML1O00423 815 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN3-207ENST00000559494 BACH1O14867 736 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN3-207ENST00000559494 PSAPP07602 524 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms