RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 CPA1P15085 419 aa24.85■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 FUT2Q10981 343 aa24.85■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 FAM117BQ6P1L5 589 aa24.85■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.85■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 Q6ZUG5 572 aa24.85■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.85■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 NRCAMQ92823 1304 aa24.85■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 CHD9Q3L8U1 2897 aa24.84■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 STXBP3O00186 592 aa24.84■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 MARK3P27448 753 aa24.84■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 CDC27P30260 824 aa24.84■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 RCAN1P53805 252 aa24.84■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 APOBRQ0VD83 1088 aa24.84■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 TJAP1Q5JTD0 557 aa24.84■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.84■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 PGBD1Q96JS3 809 aa24.84■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.84■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 GLT8D2Q9H1C3 349 aa24.84■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 BARHL2Q9NY43 387 aa24.84■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 ERAP1Q9NZ08 941 aa24.84■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 THEGQ9P2T0 379 aa24.84■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 ARHGEF15O94989 841 aa24.83■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 REC8O95072 547 aa24.83■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 GJB5O95377 273 aa24.83■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 AMHP03971 560 aa24.83■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 HSPA4P34932 840 aa24.83■■□□□ 1.57
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CIPC-208ENST00000557115 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.83■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.83■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 SEPT8Q92599 483 aa24.83■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 BRF1Q92994 677 aa24.83■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 RAD9AQ99638 391 aa24.83■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 ANO3Q9BYT9 981 aa24.83■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa24.83■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CIPC-208ENST00000557115 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa24.82■■□□□ 1.56
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CIPC-208ENST00000557115 PPFIA1Q13136 1202 aa24.82■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.82■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 KCNB2Q92953 911 aa24.82■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 SDF4Q9BRK5 362 aa24.82■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 KCNH7Q9NS40 1196 aa24.82■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.82■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 LCHNA4D1U4 455 aa24.81■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 EPOPA6NHQ4 379 aa24.81■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.81■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 PSMA5P28066 241 aa24.81■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 ZNF76P36508 570 aa24.81■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.81■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 AZI2Q9H6S1 392 aa24.81■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 TMEM260Q9NX78 707 aa24.81■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 SLC9A2Q9UBY0 812 aa24.81■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 AP3B2Q13367 1082 aa24.8■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 CEP55Q53EZ4 464 aa24.8■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 RSPH3Q86UC2 560 aa24.8■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 IL27Q8NEV9 243 aa24.8■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 CYP2W1Q8TAV3 490 aa24.8■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 DOCK5Q9H7D0 1870 aa24.79■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 NEFLP07196 543 aa24.79■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 SCG2P13521 617 aa24.79■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 ADAM17P78536 824 aa24.79■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 GRIK4Q16099 956 aa24.79■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.79■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.79■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 MTUS1Q9ULD2 1270 aa24.79■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 MTCH2Q9Y6C9 303 aa24.79■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 ARP10275 920 aa24.78■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 RPS6KB1P23443 525 aa24.78■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 SREBF1P36956 1147 aa24.78■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 IGBP1P78318 339 aa24.78■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.78■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 CHD7Q9P2D1 2997 aa24.78■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 INSL6Q9Y581 213 aa24.78■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 CUL9Q8IWT3 2517 aa24.78■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.77■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 SPRED2Q7Z698 418 aa24.77■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 ASB2Q96Q27 587 aa24.77■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 TRPC6Q9Y210 931 aa24.77■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 NFASCO94856 1347 aa24.77■■□□□ 1.56
CIPC-208ENST00000557115 LINC01553A4QN01 128 aa24.76■■□□□ 1.55
CIPC-208ENST00000557115 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CIPC-208ENST00000557115 ACTR2P61160 394 aa24.76■■□□□ 1.55
CIPC-208ENST00000557115 GRB10Q13322 594 aa24.76■■□□□ 1.55
CIPC-208ENST00000557115 FAM26DQ5JW98 314 aa24.76■■□□□ 1.55
CIPC-208ENST00000557115 KRT40Q6A162 431 aa24.76■■□□□ 1.55
CIPC-208ENST00000557115 APBB2Q92870 758 aa24.76■■□□□ 1.55
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