RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	WNT8B	Q93098	351 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	FAM161B	Q96MY7	647 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	SLC9A7	Q96T83	725 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	EMSY	Q7Z589	1322 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	NRCAM	Q92823	1304 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	NBN	O60934	754 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	EFCAB14	O75071	495 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	LGR5	O75473	907 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ARHGAP4	P98171	946 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	GRIN2C	Q14957	1233 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	BICD2	Q8TD16	824 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	PHKB	Q93100	1093 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	TREH	O43280	583 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ATG7	O95352	703 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	AR	P10275	920 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	CIITA	P33076	1130 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	TMEM260	Q9NX78	707 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	EYS	Q5T1H1	3165 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ZBBX	A8MT70	800 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	FAM86B1	E9PN63	330 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	RSPH10B	P0C881	870 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	FAM26D	Q5JW98	314 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	MYLIP	Q8WY64	445 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	PCYT2	Q99447	389 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		13.08	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	ADAMTS3	O15072	1205 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	THPO	P40225	353 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	SLC26A2	P50443	739 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	ACTR2	P61160	394 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	SP4	Q02446	784 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	GBF1	Q92538	1859 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	CPLX1	O14810	134 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	DEXI	O95424	95 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	FOSL2	P15408	326 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	ZNF76	P36508	570 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	USP11	P51784	963 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	RABGGTB	P53611	331 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	PPFIA1	Q13136	1202 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	IKBKE	Q14164	716 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CS-223	ENST00000551137	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.07	□□□□□ -0.32

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 254.9 ms