RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 ASTN1O14525 1302 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 ZBTB43O43298 467 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 TRAK2O60296 914 aa11.12□□□□□ -0.63
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CS-217ENST00000550044 SPZ1Q9BXG8 430 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa11.11□□□□□ -0.63
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CS-217ENST00000550044 COL20A1Q9P218 1284 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
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CS-217ENST00000550044 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa11.11□□□□□ -0.63
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CS-217ENST00000550044 OPLAHO14841 1288 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 CCL23P55773 120 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 C8orf34Q49A92 452 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 HLA-CQ95604 372 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 TM6SF1Q9BZW5 370 aa11.1□□□□□ -0.63
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CS-217ENST00000550044 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 MCM3APO60318 1980 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 BRWD1Q9NSI6 2320 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 EPOPA6NHQ4 379 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 PRR33A8MZF0 331 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 PI4K2BG5E9Z4 385 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 ADCY6O43306 1168 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 PPFIA3O75145 1194 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 CA3P07451 260 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 PTGS1P23219 599 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 CST5P28325 142 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.636e-6■■■□□ 15.4
CS-217ENST00000550044 CCT2P78371 535 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 TRAF1Q13077 416 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 AMHR2Q16671 573 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 TMEM63BQ5T3F8 832 aa11.09□□□□□ -0.63
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CS-217ENST00000550044 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
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CS-217ENST00000550044 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 CD4P01730 458 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 POLR2MP0CAP2 368 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
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