RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 NEK9Q8TD19 979 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 PGBD1Q96JS3 809 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 KAT14Q9H8E8 782 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 LINC01553A4QN01 128 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM232C9JQI7 657 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 NMT2O60551 498 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 GJB5O95377 273 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 MMP1P03956 469 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 XBP1P17861 261 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 GNAQP50148 359 aa22.71■■□□□ 1.23
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CTDSP2-204ENST00000548823 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 SYCE3A1L190 88 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 ALAS1P13196 640 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 STAT2P52630 851 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 DEFB103AP81534 67 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
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CTDSP2-204ENST00000548823 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
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CTDSP2-204ENST00000548823 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 NOD1Q9Y239 953 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 KPNA6O60684 536 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 TTLL1O95922 423 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 GRM4Q14833 912 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM160B2Q86V87 743 aa22.69■■□□□ 1.22
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CTDSP2-204ENST00000548823 PNMA1Q8ND90 353 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 CEP95Q96GE4 821 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM50BQ9Y247 325 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 LCTP09848 1927 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 GPNMBQ14956 572 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 PKN1Q16512 942 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 CAGE1Q8TC20 777 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A1W2PQ27 194 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A1W2PQ64 194 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A1W2PQD8 194 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.67■■□□□ 1.22
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CTDSP2-204ENST00000548823 ZP2Q05996 745 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 PHOX2BQ99453 314 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.66■■□□□ 1.22
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CTDSP2-204ENST00000548823 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 ADALQ6DHV7 355 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 NSMFQ6X4W1 530 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 A6NJR5 290 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 PLA2G6O60733 806 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 LIG1P18858 919 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 SMARCA1P28370 1054 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 STK38Q15208 465 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 PTGISQ16647 500 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
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CTDSP2-204ENST00000548823 GMCL1Q96IK5 515 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 TSPY26PQ9H489 355 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.221e-6■■■□□ 16.7
CTDSP2-204ENST00000548823 EFCAB14O75071 495 aa22.64■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP6R2O75170 966 aa22.64■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 CXCL10P02778 98 aa22.64■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 SELPP16109 830 aa22.64■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC39A14Q15043 492 aa22.64■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 PTPROQ16827 1216 aa22.64■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.64■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 BICD2Q8TD16 824 aa22.64■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.64■■□□□ 1.22
CTDSP2-204ENST00000548823 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.64■■□□□ 1.22
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