RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.2■□□□□ 0.82
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BRF1-209ENST00000547052 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 LGALS2P05162 132 aa20.19■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 ZNF286BP0CG31 522 aa20.19■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 ACTR2P61160 394 aa20.19■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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BRF1-209ENST00000547052 SLC26A2P50443 739 aa20.18■□□□□ 0.82
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BRF1-209ENST00000547052 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.18■□□□□ 0.82
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BRF1-209ENST00000547052 TCHHQ07283 1943 aa20.17■□□□□ 0.82
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BRF1-209ENST00000547052 GNAT1P11488 350 aa20.17■□□□□ 0.82
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BRF1-209ENST00000547052 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.17■□□□□ 0.82
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BRF1-209ENST00000547052 ERMNQ8TAM6 284 aa20.17■□□□□ 0.82
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BRF1-209ENST00000547052 ZNF302Q9NR11 478 aa20.17■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 DISC1Q9NRI5 854 aa20.17■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.17■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 STK24Q9Y6E0 443 aa20.17■□□□□ 0.82
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BRF1-209ENST00000547052 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.16■□□□□ 0.82
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BRF1-209ENST00000547052 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.16■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.16■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.16■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 FAM167AQ96KS9 214 aa20.16■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 MTMR6Q9Y217 621 aa20.16■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.16■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 PSMD10O75832 226 aa20.15■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 TXKP42681 527 aa20.15■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 RGS19P49795 217 aa20.15■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 RTP1P59025 263 aa20.15■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 PPP2R5CQ13362 524 aa20.15■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.15■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
BRF1-209ENST00000547052 TRPC6Q9Y210 931 aa20.15■□□□□ 0.82
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BRF1-209ENST00000547052 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.14■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.14■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.14■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.14■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.14■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.13■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 PSMC6P62333 389 aa20.13■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 PTGDRQ13258 359 aa20.13■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 SNX17Q15036 470 aa20.13■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.13■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.13■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 NEK9Q8TD19 979 aa20.13■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 TOX2Q96NM4 488 aa20.13■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.13■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.13■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 LGR5O75473 907 aa20.12■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 ATG7O95352 703 aa20.12■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 CCNE2O96020 404 aa20.12■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 F13A1P00488 732 aa20.12■□□□□ 0.81
BRF1-209ENST00000547052 PRPHP41219 470 aa20.12■□□□□ 0.81
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