RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	NEDD9	Q14511	834 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	HIC1	Q14526	733 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	PCYT2	Q99447	389 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	PHF24	Q9UPV7	400 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	KIF3A	Q9Y496	699 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	LTBP2	Q14767	1821 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477		A0A087WWV3	80 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	NEMF	O60524	1076 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	LAMC2	Q13753	1193 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	UGCG	Q16739	394 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	DGKD	Q16760	1214 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	TTC38	Q5R3I4	469 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	DPF3	Q92784	378 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	SDF4	Q9BRK5	362 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	EML1	O00423	815 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	TXK	P42681	527 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	ITGA7	Q13683	1181 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	CDHR1	Q96JP9	859 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	PSMD10	O75832	226 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	F2	P00734	622 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	CYP3A7	P24462	503 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	CDC25A	P30304	524 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	RTP1	P59025	263 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	CYP4A11	Q02928	519 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	CALCRL	Q16602	461 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477		Q4G0T1	1027 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	BANK1	Q8NDB2	785 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	GLG1	Q92896	1179 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477		Q9Y3F1	56 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477		H3BRB1	525 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	BACH1	O14867	736 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	B4GALT4	O60513	344 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	CYP2C9	P11712	490 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	ITGB8	P26012	769 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	IGBP1	P78318	339 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	TLE2	Q04725	743 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	REST	Q13127	1097 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	SLC5A5	Q92911	643 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	MBOAT7	Q96N66	472 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	VAV3	Q9UKW4	847 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	MYH11	P35749	1972 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	ELP1	O95163	1332 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	PP2D1	A8MPX8	630 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	MARCH6	O60337	910 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	GRIN1	Q05586	938 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	PTGDR	Q13258	359 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	MFSD10	Q14728	455 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	WNT8B	Q93098	351 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	ZBTB39	O15060	712 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	TEC	P42680	631 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	MCTP2	Q6DN12	878 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	IL27	Q8NEV9	243 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
MLH1-222	ENST00000539477	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		10.47	□□□□□ -0.73

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