RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537007.5

MRPL48-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L48, human

TSL 3

Gene MRPL48, Length 287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL48-208	ENST00000537007	JDP2	Q8WYK2	163 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	MRI	Q9BWK5	157 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	ATRX	P46100	2492 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	WASH4P	A8MWX3	477 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	ADM5	C9JUS6	153 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	MATN3	O15232	486 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	NRDC	O43847	1150 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	PGR	P06401	933 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	TM4SF4	P48230	202 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	CDR1	P51861	262 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	NHLH1	Q02575	133 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	MAP3K11	Q16584	847 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007		Q96M66	194 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	TJP1	Q07157	1748 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	GPR182	O15218	404 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	C6	P13671	934 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	FOSL2	P15408	326 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	ITGAE	P38570	1179 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	TNNI2	P48788	182 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	GALK1	P51570	392 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	SLURP1	P55000	103 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	TEK	Q02763	1124 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	LAPTM5	Q13571	262 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	STYK1	Q6J9G0	422 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	TMC6	Q7Z403	805 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	CHST13	Q8NET6	341 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	IP6K1	Q92551	441 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	ERO1A	Q96HE7	468 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	TMEM87B	Q96K49	555 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	LAMB2	P55268	1798 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	C5orf42	Q9H799	3197 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	SHTN1	A0MZ66	631 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	GIPC1	O14908	333 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	PAGE1	O75459	146 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	SRGN	P10124	158 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	VAMP1	P23763	118 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	ERVFRD-1	P60508	538 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	GIPC2	Q8TF65	315 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	RNF141	Q8WVD5	230 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	MASTL	Q96GX5	879 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	NBPF4	Q96M43	638 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	ASB2	Q96Q27	587 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	USP34	Q70CQ2	3546 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	FBXO24	O75426	580 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPL48-208	ENST00000537007	TACR2	P21452	398 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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