RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 VEZTQ9HBM0 779 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 TBC1D22BQ9NU19 505 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 ABHD10Q9NUJ1 306 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 PANK4Q9NVE7 773 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 FBXL5Q9UKA1 691 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 MYO6Q9UM54 1294 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 ADGRG1Q9Y653 693 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 RLFQ13129 1914 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 PHIPQ8WWQ0 1821 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 ZNF536O15090 1300 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 TUBBP07437 444 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 GUCY2CP25092 1073 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 RPL13P26373 211 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 ZNF76P36508 570 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 PRELPP51888 382 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 ZNF131P52739 623 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 BACE1P56817 501 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 KRT83P78385 493 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 ENPEPQ07075 957 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 VWA3BQ502W6 1294 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 MIIPQ5JXC2 388 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 FRMD5Q7Z6J6 570 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 GPC2Q8N158 579 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 GOLGA5Q8TBA6 731 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 ANKRD7Q92527 254 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 SENP7Q9BQF6 1050 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 KCTD10Q9H3F6 313 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 HAUS4Q9H6D7 363 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 DNAI1Q9UI46 699 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 SMCHD1A6NHR9 2005 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 SBF1O95248 1867 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 UNCXA6NJT0 531 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 USP27XA6NNY8 438 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 ZBED4O75132 1171 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 MED24O75448 989 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 SLU7O95391 586 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 LCA5LO95447 670 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 FCER1AP12319 257 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 CASP14P31944 242 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 SFNP31947 248 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 KRT9P35527 623 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 GIT2Q14161 759 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 KCNK18Q7Z418 384 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 GPBP1Q86WP2 473 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 MICALL2Q8IY33 904 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 CLEC4DQ8WXI8 215 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 CDHR1Q96JP9 859 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 TEKT3Q9BXF9 490 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 VPS16Q9H269 839 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 NDST4Q9H3R1 872 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 JADE2Q9NQC1 790 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 METRNQ9UJH8 293 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 CCPG1Q9ULG6 757 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
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