RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP3A7P24462 503 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 Q4G0T1 1027 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM50Q86XT4 487 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 EMSYQ7Z589 1322 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 BTBD18B2RXH4 712 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ITGB8P26012 769 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ACTR2P61160 394 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 GUCY1B3Q02153 619 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 C7orf31Q8N865 590 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 PRO3102Q9H379 93 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM205CA6NFA0 338 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 MSH4O15457 936 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 LGR5O75473 907 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 LETM2Q2VYF4 491 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 BADQ92934 168 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 UIMC1Q96RL1 719 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF3AQ9Y496 699 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ATG7O95352 703 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 CCNE2O96020 404 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 TIMP1P01033 207 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 BMP8BP34820 402 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 PTGISQ16647 500 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC5A5Q92911 643 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT76Q01546 638 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 GLG1Q92896 1179 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 PCYT2Q99447 389 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 RIT2Q99578 217 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 HIPK3Q9H422 1215 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 NOD1Q9Y239 953 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 EVPLQ92817 2033 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC37A4O43826 429 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP2C9P11712 490 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 GJB2P29033 226 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 HOXC8P31273 242 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 CUL4AQ13619 759 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 TEKT3Q9BXF9 490 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 AZI2Q9H6S1 392 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 GAS7O60861 476 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 HIC1Q14526 733 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 MFSD5Q6N075 450 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 PSMD10O75832 226 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 MARK3P27448 753 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP2C18P33260 490 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 STAT5BP51692 787 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 FPGSQ05932 587 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 GJA10Q969M2 543 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 TET1Q8NFU7 2136 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A1W2PPC1 479 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM160B1Q5W0V3 765 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM199Q8N511 208 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 AFAP1L1Q8TED9 768 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 SIP14410 1827 aa21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.8 ms