RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514305.5

USP53-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 53, humanhuman

TSL 2

Gene USP53, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53-208ENST00000514305 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 IL23AQ9NPF7 189 aa22.88■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.87■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 CYP3A4P08684 503 aa22.87■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 FOSL2P15408 326 aa22.87■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 ARHGAP4P98171 946 aa22.87■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 NPY5RQ15761 445 aa22.87■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.87■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 ZNF365Q70YC5 407 aa22.87■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.87■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.87■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 TBCKQ8TEA7 893 aa22.87■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 MYLIPQ8WY64 445 aa22.87■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 METRNQ9UJH8 293 aa22.87■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.86■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 PYGBP11216 843 aa22.86■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 TTLL4Q14679 1199 aa22.86■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 BRAPQ7Z569 592 aa22.86■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 NEK8Q86SG6 692 aa22.86■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.86■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 KPNA6O60684 536 aa22.85■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 TGFB3P10600 412 aa22.85■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 TRAPPC10P48553 1259 aa22.85■■□□□ 1.25
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USP53-208ENST00000514305 NR5A1Q13285 461 aa22.85■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.85■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 OXER1Q8TDS5 423 aa22.85■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 SLC39A7Q92504 469 aa22.85■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 TIFAQ96CG3 184 aa22.85■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 PGBD1Q96JS3 809 aa22.85■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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USP53-208ENST00000514305 A0A0C4DFX4 3053 aa22.85■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.84■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.84■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 FGBP02675 491 aa22.84■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 RASIP1Q5U651 963 aa22.84■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.84■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 GPRASP2Q96D09 838 aa22.84■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 GBF1Q92538 1859 aa22.83■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 CDH23Q9H251 3354 aa22.83■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 C7P10643 843 aa22.83■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 CIITAP33076 1130 aa22.83■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 INF2Q27J81 1249 aa22.83■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 CEP55Q53EZ4 464 aa22.83■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.83■■□□□ 1.25
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USP53-208ENST00000514305 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.83■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 ZNF576Q9H609 170 aa22.83■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 A6NJR5 290 aa22.82■■□□□ 1.24
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USP53-208ENST00000514305 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.82■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
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USP53-208ENST00000514305 TNFRSF25Q93038 417 aa22.82■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
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USP53-208ENST00000514305 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.82■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.82■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.81■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 MTMR1Q13613 665 aa22.81■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 LETM2Q2VYF4 491 aa22.81■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.81■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.81■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 PBX4Q9BYU1 374 aa22.81■■□□□ 1.24
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USP53-208ENST00000514305 MSRAQ9UJ68 235 aa22.81■■□□□ 1.24
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USP53-208ENST00000514305 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.8■■□□□ 1.24
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USP53-208ENST00000514305 ICAM3P32942 547 aa22.8■■□□□ 1.24
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USP53-208ENST00000514305 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.8■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.8■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 IL31RAQ8NI17 732 aa22.8■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.8■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 MTMR6Q9Y217 621 aa22.8■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.8■■□□□ 1.24
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