RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512427.5

HOXC-AS1-202, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene HOXC-AS1, Length 290 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SETD4Q9NVD3 440 aa10.7□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MAD2L2Q9UI95 211 aa10.7□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CD207Q9UJ71 328 aa10.7□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NLRC5Q86WI3 1866 aa10.7□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FRMPD4Q14CM0 1322 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 STXBP3O00186 592 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MMP1P03956 469 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NDUFV1P49821 464 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HYAL1Q12794 435 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SART3Q15020 963 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HFE2Q6ZVN8 426 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NLRX1Q86UT6 975 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LMBR1Q8WVP7 490 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 P2RX5Q93086 422 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CDHR1Q96JP9 859 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RIOX1Q9H6W3 641 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FSD2A1L4K1 749 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 M0QZ92 97 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GRM6O15303 877 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GHRP10912 638 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LTBRP36941 435 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PTPN5P54829 565 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RRP1P56182 461 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ADAM17P78536 824 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GRM4Q14833 912 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SEC23AQ15436 765 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CLUL1Q15846 466 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRIM50Q86XT4 487 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RNF135Q8IUD6 432 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EDAQ92838 391 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PIGSQ96S52 555 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FTHL17Q9BXU8 183 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OSBPL3Q9H4L5 887 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IGFLR1Q9H665 355 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ERAP1Q9NZ08 941 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MUTYHQ9UIF7 546 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TUBE1Q9UJT0 475 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CHRNA1P02708 482 aa10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 STAG3L1P0CL83 205 aa10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SP4Q02446 784 aa10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPFIA1Q13136 1202 aa10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PCNX4Q63HM2 1172 aa10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EHMT1Q9H9B1 1298 aa10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RTEL1Q9NZ71 1219 aa10.67□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RRN3P2A6NIE6 340 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ENPP3O14638 875 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TBX10O75333 385 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DGKIO75912 1065 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EYA4O95677 639 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ADAM15Q13444 863 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LPIN1Q14693 890 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WTAPQ15007 396 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GRIK4Q16099 956 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IER5Q5VY09 327 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CATIPQ7Z7H3 387 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CHD1LQ86WJ1 897 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NPAS4Q8IUM7 802 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SEPT1Q8WYJ6 367 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GLG1Q92896 1179 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GPRASP2Q96D09 838 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PLAGL2Q9UPG8 496 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SQORQ9Y6N5 450 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WDFY4Q6ZS81 3184 aa10.65□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMEM221A6NGB7 291 aa10.65□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 M0R296 226 aa10.65□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PIK3CDO00329 1044 aa10.65□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CSPG5O95196 566 aa10.65□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LINC00271P0C7V0 271 aa10.65□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SRGAP2BP0DMP2 458 aa10.65□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIF5BP33176 963 aa10.65□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MGAT3Q09327 533 aa10.65□□□□□ -0.7
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SEMA3FQ13275 785 aa10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms