RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 UGGT2Q9NYU1 1516 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 K7ESM1 405 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 CNR2P34972 360 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 DTLQ9NZJ0 730 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 TTC37Q6PGP7 1564 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF28P17035 718 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 NKX3-2P78367 333 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 CYP4F22Q6NT55 531 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 TEPPQ6URK8 271 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 BORCS6Q96GS4 357 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 GPR20Q99678 358 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 STRCQ7RTU9 1775 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 GOLGA3Q08378 1498 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 DGKIO75912 1065 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 RGL3Q3MIN7 710 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 PROSER1Q86XN7 944 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 DCAF4Q8WV16 495 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 JAM3Q9BX67 310 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 EFCAB5A4FU69 1503 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 IQCA1LA6NCM1 817 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 ITGB3P05106 788 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 INSRRP14616 1297 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 LBX2Q6XYB7 198 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 MYOTQ9UBF9 498 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 FHOD3Q2V2M9 1422 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 ABCA8O94911 1581 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 ABCA9Q8IUA7 1624 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 PRODHO43272 600 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF827Q17R98 1081 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 STYK1Q6J9G0 422 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 USP53Q70EK8 1073 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 CLEC4DQ8WXI8 215 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 MBD6Q96DN6 1003 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 NCOA1Q15788 1441 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 ATP10BO94823 1461 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 MAGI2Q86UL8 1455 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 MROH6A6NGR9 719 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 C9orf118A6NHY6 69 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 MCTP2Q6DN12 878 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 NSMFQ6X4W1 530 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-217ENST00000509355 ADCY3O60266 1144 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 C9orf84Q5VXU9 1444 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 ATP10AO60312 1499 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 PLEKHD1A6NEE1 506 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 E9PSI1 815 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 KRIT1O00522 736 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 MAFKO60675 156 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 PLATP00750 562 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 COL6A1P12109 1028 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 IL13P35225 146 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 GPR85P60893 370 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 SPATC1Q76KD6 591 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 TRIM48Q8IWZ4 208 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-217ENST00000509355 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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