RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 M0R2N6 131 aa28.4■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 PITPNM1O00562 1244 aa28.4■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 ST18O60284 1047 aa28.4■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF365Q70YC5 407 aa28.4■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 C16orf59Q7L2K0 433 aa28.4■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 H3BRB1 525 aa28.39■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 TRIM50Q86XT4 487 aa28.39■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 DEFB123Q8N688 67 aa28.39■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 TBCKQ8TEA7 893 aa28.39■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 SEPT1Q8WYJ6 367 aa28.39■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 BACH2Q9BYV9 841 aa28.39■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 TANC1Q9C0D5 1861 aa28.39■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 SLC9A2Q9UBY0 812 aa28.39■■■□□ 2.14
CXCL3-202ENST00000502974 NFASCO94856 1347 aa28.39■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 CIITAP33076 1130 aa28.38■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 FOSBP53539 338 aa28.38■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 SETQ01105 290 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 PRR16Q569H4 304 aa28.38■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 UIMC1Q96RL1 719 aa28.38■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa28.37■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 FGBP02675 491 aa28.37■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 Q7L0L9 218 aa28.37■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 KRT25Q7Z3Z0 450 aa28.37■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 CAGE1Q8TC20 777 aa28.37■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 SCN5AQ14524 2016 aa28.36■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 USP11P51784 963 aa28.36■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF577Q9BSK1 485 aa28.36■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa28.35■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 EDIL3O43854 480 aa28.35■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 PFKMP08237 780 aa28.35■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 RFC2P35250 354 aa28.35■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 OXER1Q8TDS5 423 aa28.35■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 HERVK_113Q902F9 699 aa28.35■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 CTAGE1Q96RT6 745 aa28.35■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 IQCF3P0C7M6 154 aa28.34■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 ACTR2P61160 394 aa28.34■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 TRIM29Q14134 588 aa28.34■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 INF2Q27J81 1249 aa28.34■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF697Q5TEC3 545 aa28.34■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 OTOP2Q7RTS6 562 aa28.34■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 DEFB128Q7Z7B8 93 aa28.34■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 AFAP1L1Q8TED9 768 aa28.34■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 BRMS1Q9HCU9 246 aa28.34■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 KRT2P35908 639 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 PTK7Q13308 1070 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 RASIP1Q5U651 963 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 IL27Q8NEV9 243 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 GLG1Q92896 1179 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 LENG9Q96B70 501 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL3-202ENST00000502974 KAT6AQ92794 2004 aa28.32■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 DHX15O43143 795 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 TDP2O95551 362 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 SELPP16109 830 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 MARK3P27448 753 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 NR5A1Q13285 461 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 HIC1Q14526 733 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 KRT40Q6A162 431 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 LRRC8DQ7L1W4 858 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 TBC1D22BQ9NU19 505 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 EMSYQ7Z589 1322 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 ZBBXA8MT70 800 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 CCNE2O96020 404 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 MMP1P03956 469 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 GNAT1P11488 350 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 ACTN1P12814 892 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 RBL2Q08999 1139 aa28.3■■■□□ 2.12
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CXCL3-202ENST00000502974 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 RNPEPQ9H4A4 650 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 AZI2Q9H6S1 392 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 ERAP1Q9NZ08 941 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 MSH4O15457 936 aa28.29■■■□□ 2.12
CXCL3-202ENST00000502974 LGR5O75473 907 aa28.29■■■□□ 2.12
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