RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 TPH2Q8IWU9 490 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 CNMDO75829 334 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 TRIM49BA6NDI0 452 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 PPP1R2P41236 205 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 PSMD2Q13200 908 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 SNAPC2Q13487 334 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 KCNF1Q9H3M0 494 aa29.02■■■□□ 2.24
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HOXB3-212ENST00000498678 FBXO40Q9UH90 709 aa29.02■■■□□ 2.24
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HOXB3-212ENST00000498678 TBC1D22BQ9NU19 505 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 INTS13Q9NVM9 706 aa29.01■■■□□ 2.23
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HOXB3-212ENST00000498678 ATP9AO75110 1047 aa29■■■□□ 2.23
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HOXB3-212ENST00000498678 BHMT2Q9H2M3 363 aa29■■■□□ 2.23
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HOXB3-212ENST00000498678 CCNE1P24864 410 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa28.99■■■□□ 2.23
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HOXB3-212ENST00000498678 CCDC65Q8IXS2 484 aa28.99■■■□□ 2.23
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HOXB3-212ENST00000498678 P2RX5Q93086 422 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 GPRASP2Q96D09 838 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 TXNRD2Q9NNW7 524 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 IMPACTQ9P2X3 320 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 RBPJLQ9UBG7 517 aa28.99■■■□□ 2.23
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HOXB3-212ENST00000498678 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
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HOXB3-212ENST00000498678 FRMD3A2A2Y4 597 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 TPM2P07951 284 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 GIT2Q14161 759 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 NEK9Q8TD19 979 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
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HOXB3-212ENST00000498678 BANK1Q8NDB2 785 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 NACC1Q96RE7 527 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 LXNQ9BS40 222 aa28.96■■■□□ 2.23
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HOXB3-212ENST00000498678 NR1I3Q14994 352 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 FAM26FQ5R3K3 315 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 IRF2BP1Q8IU81 584 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 VSTM4Q8IW00 320 aa28.96■■■□□ 2.23
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HOXB3-212ENST00000498678 IWS1Q96ST2 819 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXB3-212ENST00000498678 ASTN1O14525 1302 aa28.95■■■□□ 2.23
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HOXB3-212ENST00000498678 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa28.95■■■□□ 2.23
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HOXB3-212ENST00000498678 SLC25A27O95847 323 aa28.95■■■□□ 2.22
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HOXB3-212ENST00000498678 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
HOXB3-212ENST00000498678 LRRC10BA6NIK2 292 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXB3-212ENST00000498678 ARID5BQ14865 1188 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXB3-212ENST00000498678 LRRC41Q15345 812 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXB3-212ENST00000498678 RINT1Q6NUQ1 792 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXB3-212ENST00000498678 MS4A4AQ96JQ5 239 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXB3-212ENST00000498678 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
HOXB3-212ENST00000498678 THAP9Q9H5L6 903 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXB3-212ENST00000498678 CELF2O95319 508 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
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