RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490540.1

ASIC3-208, Transcript of acid sensing ion channel subunit 3, human

TSL 2

Gene ASIC3, Length 520 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASIC3-208	ENST00000490540	HSPA4	P34932	840 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	FGD1	P98174	961 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	RBL2	Q08999	1139 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540		Q6ZUG5	572 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	KCNB2	Q92953	911 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	BRF1	Q92994	677 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	TMEM260	Q9NX78	707 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	NCOR1	O75376	2440 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	STXBP3	O00186	592 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	TREH	O43280	583 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	KCNA2	P16389	499 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	THPO	P40225	353 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	SCN5A	Q14524	2016 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	ADAMTS3	O15072	1205 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	BAIAP3	O94812	1187 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	CTSH	P09668	335 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	ADCY7	P51828	1080 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	DEFB103A	P81534	67 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	MTMR1	Q13613	665 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	CXCL10	P02778	98 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	MARK3	P27448	753 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	HOXC8	P31273	242 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	JADE2	Q9NQC1	790 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	TRANK1	O15050	2925 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	REC8	O95072	547 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	RSPH10B	P0C881	870 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	ARHGAP4	P98171	946 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	PHKB	Q93100	1093 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	CD320	Q9NPF0	282 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	BARHL2	Q9NY43	387 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	LGR5	O75473	907 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	AR	P10275	920 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	RCAN1	P53805	252 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	UIMC1	Q96RL1	719 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	NID2	Q14112	1375 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	SCG2	P13521	617 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	ADAM17	P78536	824 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	GLG1	Q92896	1179 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	PCYT2	Q99447	389 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ASIC3-208	ENST00000490540	RAD9A	Q99638	391 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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