RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	MYLIP	Q8WY64	445 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0C4DFX4	3053 aa		19.72	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		19.72	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP9A	O75110	1047 aa		19.72	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	FOSL2	P15408	326 aa		19.72	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	PBX2	P40425	430 aa		19.72	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	IL27	Q8NEV9	243 aa		19.72	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	BICD2	Q8TD16	824 aa		19.72	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ANO3	Q9BYT9	981 aa		19.72	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	C6orf50	Q9HD87	102 aa		19.72	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		19.72	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		19.72	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	19.71	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC26A2	P50443	739 aa		19.71	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	19.71	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	IKBKE	Q14164	716 aa		19.71	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	NTRK3	Q16288	839 aa		19.71	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		19.71	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		19.71	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		19.71	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	NBN	O60934	754 aa		19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	LGR5	O75473	907 aa		19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	RSPH10B	P0C881	870 aa		19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNJ6	P48051	423 aa		19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	NEK4	P51957	841 aa		19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	HIC1	Q14526	733 aa		19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	PKN1	Q16512	942 aa		19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM26D	Q5JW98	314 aa		19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	IL17RA	Q96F46	866 aa		19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	SDF4	Q9BRK5	362 aa		19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	19.7	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		19.69	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	TET1	Q8NFU7	2136 aa		19.69	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		19.69	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	ATG7	O95352	703 aa		19.69	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP4	P98171	946 aa		19.69	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	CDH23	Q9H251	3354 aa		19.69	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		19.69	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	19.68	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	TREH	O43280	583 aa		19.68	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	SORBS3	O60504	671 aa		19.68	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	THPO	P40225	353 aa		19.68	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	19.68	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	19.68	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	APBB2	Q92870	758 aa		19.68	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		19.68	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	SETD4	Q9NVD3	440 aa		19.68	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		19.68	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	CPLX1	O14810	134 aa		19.67	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	CIITA	P33076	1130 aa		19.67	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	19.67	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	19.67	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	19.67	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		19.67	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	19.67	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		19.67	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	RSPH3	Q86UC2	560 aa		19.67	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	19.67	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	19.67	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	WNT8B	Q93098	351 aa		19.67	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	AZI2	Q9H6S1	392 aa		19.67	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	19.67	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		19.67	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		19.67	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		19.66	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF76	P36508	570 aa		19.66	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	19.66	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	MBTPS1	Q14703	1052 aa		19.66	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	GALNT17	Q6IS24	598 aa		19.66	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		19.66	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		19.66	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	GLG1	Q92896	1179 aa		19.66	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	RAD9A	Q99638	391 aa		19.66	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	BACH2	Q9BYV9	841 aa		19.66	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	GJB5	O95377	273 aa		19.65	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	USP11	P51784	963 aa		19.65	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	PPFIA1	Q13136	1202 aa		19.65	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM50	Q86XT4	487 aa		19.65	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		19.65	■□□□□ 0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	SEPT8	Q92599	483 aa		19.65	■□□□□ 0.74

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