RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487411.5

STX4-210, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene STX4, Length 1,290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-210ENST00000487411 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 ME3Q16798 604 aa25.73■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 PLA2G4DQ86XP0 818 aa25.73■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.73■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.73■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 HERVK_113Q902F9 699 aa25.73■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 EMSYQ7Z589 1322 aa25.72■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 CTDNEP1O95476 244 aa25.72■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 FGBP02675 491 aa25.72■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 CIITAP33076 1130 aa25.72■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 NPY5RQ15761 445 aa25.72■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 GALNT17Q6IS24 598 aa25.72■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 GTF3C6Q969F1 213 aa25.72■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 M0R2N6 131 aa25.71■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 SERINC5Q86VE9 423 aa25.71■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 BLIDQ8IZY5 108 aa25.71■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.71■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 RNPEPQ9H4A4 650 aa25.71■■□□□ 1.71
STX4-210ENST00000487411 LGR5O75473 907 aa25.7■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 CKBP12277 381 aa25.7■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 SELPP16109 830 aa25.7■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 ACTR2P61160 394 aa25.7■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 LRRC8DQ7L1W4 858 aa25.7■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 NECAB1Q8N987 351 aa25.7■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 ATP6V0A1Q93050 837 aa25.7■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 WNT8BQ93098 351 aa25.7■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa25.7■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 GNAT1P11488 350 aa25.69■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 DEFB128Q7Z7B8 93 aa25.69■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 PCYT2Q99447 389 aa25.69■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 PHF20Q9BVI0 1012 aa25.69■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 ERAP1Q9NZ08 941 aa25.69■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 EDIL3O43854 480 aa25.68■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 PARNO95453 639 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 XBP1P17861 261 aa25.68■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 USP11P51784 963 aa25.68■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 ADAM17P78536 824 aa25.68■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.68■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 DEFB123Q8N688 67 aa25.68■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 GLG1Q92896 1179 aa25.68■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 KIF2CQ99661 725 aa25.68■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 SETD4Q9NVD3 440 aa25.68■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 NRCAMQ92823 1304 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 TREHO43280 583 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 ATG7O95352 703 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 SCN5AQ14524 2016 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 PRR16Q569H4 304 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 Q7L0L9 218 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 TBCKQ8TEA7 893 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 LMBR1Q8WVP7 490 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 WASF1Q92558 559 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 LENG9Q96B70 501 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 DTNBO60941 627 aa25.66■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 CCNE2O96020 404 aa25.66■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 MARK3P27448 753 aa25.66■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 RBM25P49756 843 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 TRAF7Q6Q0C0 670 aa25.66■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 AZI2Q9H6S1 392 aa25.66■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.66■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 ST3GAL1Q11201 340 aa25.65■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 PPFIA1Q13136 1202 aa25.65■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 GPNMBQ14956 572 aa25.65■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.65■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.65■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa25.64■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 CAND2O75155 1236 aa25.64■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 CXCL10P02778 98 aa25.64■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 ACTN1P12814 892 aa25.64■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 ZNF697Q5TEC3 545 aa25.64■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 ABHD15Q6UXT9 468 aa25.64■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa25.64■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.71e-6■□□□□ 8.5
STX4-210ENST00000487411 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.64■■□□□ 1.7
STX4-210ENST00000487411 TMEM265A0A087WTH1 108 aa25.63■■□□□ 1.69
STX4-210ENST00000487411 THPOP40225 353 aa25.63■■□□□ 1.69
STX4-210ENST00000487411 STAT5BP51692 787 aa25.63■■□□□ 1.69
STX4-210ENST00000487411 GRIK4Q16099 956 aa25.63■■□□□ 1.69
STX4-210ENST00000487411 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
STX4-210ENST00000487411 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.63■■□□□ 1.69
STX4-210ENST00000487411 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.63■■□□□ 1.69
STX4-210ENST00000487411 MTMR10Q9NXD2 777 aa25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms