RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 NR2E1Q9Y466 385 aa5.65□□□□□ -1.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa5.65□□□□□ -1.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYO1BO43795 1136 aa5.64□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 SORBS3O60504 671 aa5.64□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 NFYCQ13952 458 aa5.64□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 PROSER1Q86XN7 944 aa5.64□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.64□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 TTLL11Q8NHH1 800 aa5.64□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCYL1Q96KG9 808 aa5.64□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 NT5C1AQ9BXI3 368 aa5.64□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 NELFAQ9H3P2 528 aa5.64□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 COPRSQ9NQ92 184 aa5.64□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYOTQ9UBF9 498 aa5.64□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZFP69BQ9UJL9 534 aa5.64□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 IKBKBO14920 756 aa5.63□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 POLD1P28340 1107 aa5.63□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 INF2Q27J81 1249 aa5.63□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa5.63□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 H7BY64 318 aa5.62□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNA1Q09470 495 aa5.62□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 CRHR2Q13324 411 aa5.62□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYP4F22Q6NT55 531 aa5.62□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMOC1Q9H4F8 434 aa5.62□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPRC5CQ9NQ84 441 aa5.62□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPRC5BQ9NZH0 403 aa5.62□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa5.62□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 GJA4P35212 333 aa5.61□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAPK7Q13164 816 aa5.61□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 SKIDA1Q1XH10 827 aa5.61□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 PHF19Q5T6S3 580 aa5.61□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 NLRP10Q86W26 655 aa5.61□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 STPG3Q8N7X2 389 aa5.61□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRS2Q9HD23 443 aa5.61□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBPJLQ9UBG7 517 aa5.61□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa5.61□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC12A7Q9Y666 1083 aa5.61□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 COX11Q9Y6N1 276 aa5.61□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 CAPN14A8MX76 684 aa5.6□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 MATN2O00339 956 aa5.6□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 DGKIO75912 1065 aa5.6□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 POMZP3Q6PJE2 187 aa5.6□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF662Q6ZS27 426 aa5.6□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 HAS1Q92839 578 aa5.6□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa5.6□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 VTI1BQ9UEU0 232 aa5.6□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa5.6□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARHGAP6O43182 974 aa5.59□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 EPHX1P07099 455 aa5.59□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 BCL6P41182 706 aa5.59□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 GRM7Q14831 915 aa5.59□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNPTABQ3T906 1256 aa5.59□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRGPREQ86SM8 312 aa5.59□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa5.59□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM161BQ96MY7 647 aa5.59□□□□□ -1.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.58□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 GLRBP48167 497 aa5.58□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 D2HGDHQ8N465 521 aa5.58□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP5.58□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 FGD4Q96M96 766 aa5.58□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 FERD3LQ96RJ6 166 aa5.58□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.58□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa5.58□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRIT1O00522 736 aa5.57□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNAB2Q13303 367 aa5.57□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCOLCEQ15113 449 aa5.57□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 LCE1EQ5T753 118 aa5.57□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 AKT3Q9Y243 479 aa5.57□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAF5O00463 557 aa5.56□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC25A3Q00325 362 aa5.56□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 DIO2Q92813 273 aa5.56□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 MPHOSPH9Q99550 1183 aa5.56□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARID3AQ99856 593 aa5.56□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYP26B1Q9NR63 512 aa5.56□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPS6KA4O75676 772 aa5.55□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ETV4P43268 484 aa5.55□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 RRADP55042 308 aa5.55□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC7A5Q01650 507 aa5.55□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR162Q16538 588 aa5.55□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ERICH6Q7L0X2 663 aa5.55□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKRD35Q8N283 1001 aa5.55□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 NPLOC4Q8TAT6 608 aa5.55□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 FRS2Q8WU20 508 aa5.55□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 LENG9Q96B70 501 aa5.55□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TOR3AQ9H497 397 aa5.55□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPFIA4O75335 1185 aa5.54□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNH1O95259 989 aa5.54□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
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