RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 KCNA2P16389 499 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 ITGB5P18084 799 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 GRB10Q13322 594 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 TCTN1Q2MV58 587 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.282e-30■■■□□ 14.8
ACTB-212ENST00000484841 RSPH3Q86UC2 560 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 SKAP1Q86WV1 359 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 APBB2Q92870 758 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 JADE2Q9NQC1 790 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 ADCY7P51828 1080 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 WWC2Q6AWC2 1192 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 TAF2Q6P1X5 1199 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 SDF4Q9BRK5 362 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 AZI2Q9H6S1 392 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 A0A0C4DFX4 3053 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 MARK3P27448 753 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 PPFIA1Q13136 1202 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 COG5Q9UP83 839 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 SIP14410 1827 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 ZNF76P36508 570 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 ERVK-21P61565 698 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 LINC01553A4QN01 128 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 SMCO2A6NFE2 343 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 UPP2O95045 317 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 GRIK4Q16099 956 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 KRT40Q6A162 431 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 RASEFQ8IZ41 740 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 YME1L1Q96TA2 773 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 ADAM17P78536 824 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 FAM26DQ5JW98 314 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 HLA-CQ95604 372 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.278e-18■□□□□ 9.9
ACTB-212ENST00000484841 RCAN1P53805 252 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 IGBP1P78318 339 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 TFF2Q03403 129 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 AP3B2Q13367 1082 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 SPRED2Q7Z698 418 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 PGBD1Q96JS3 809 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 SAMD11Q96NU1 681 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 ANO3Q9BYT9 981 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 BARHL2Q9NY43 387 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 RRN3P2A6NIE6 340 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 M0QZ92 97 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 STXBP3O00186 592 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 TOP1MTQ969P6 601 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 TRPC6Q9Y210 931 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 LPXNO60711 386 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 CEP55Q53EZ4 464 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 Q6ZUG5 572 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 RPAINQ86UA6 219 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ACTB-212ENST00000484841 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.99■■□□□ 1.27
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