RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482096.1

UBE2F-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative), human

TSL 4

Gene UBE2F, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2F-222	ENST00000482096	DGKD	Q16760	1214 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	CHST3	Q7LGC8	479 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	SPRED2	Q7Z698	418 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	FBXO11	Q86XK2	927 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	TET1	Q8NFU7	2136 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	RILPL2	Q969X0	211 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	CRBN	Q96SW2	442 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	LNPK	Q9C0E8	428 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	KAT14	Q9H8E8	782 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	LCHN	A4D1U4	455 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	HAS3	O00219	553 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	NBN	O60934	754 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	NR3C2	P08235	984 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	CKB	P12277	381 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	DEFB103A	P81534	67 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	GHRHR	Q02643	423 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	PTK7	Q13308	1070 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	LAMC2	Q13753	1193 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	NR6A1	Q15406	480 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	C7orf31	Q8N865	590 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	PXMP2	Q9NR77	195 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096		B4E1Z4	1266 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	OPLAH	O14841	1288 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	EFCAB14	O75071	495 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	GJB5	O95377	273 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	F2	P00734	622 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	HSD17B4	P51659	736 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	ERVK-21	P61565	698 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	KCNH2	Q12809	1159 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	TCTN1	Q2MV58	587 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	SMC5	Q8IY18	1101 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	PPTC7	Q8NI37	304 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	RAD9A	Q99638	391 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	ALG1	Q9BT22	464 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	PPFIA4	O75335	1185 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	RGS20	O76081	388 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	CFB	P00751	764 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	PLA2G5	P39877	138 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	AAMP	Q13685	434 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	IKBKE	Q14164	716 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	WNT8B	Q93098	351 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	MTMR8	Q96EF0	704 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	AMN	Q9BXJ7	453 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	KRT23	Q9C075	422 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC01553	A4QN01	128 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	HIP1	O00291	1037 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	LGR5	O75473	907 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	ZNF286B	P0CG31	522 aa		9.98	□□□□□ -0.81

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