RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 ARP10275 920 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 KCNJ6P48051 423 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 WDR5P61964 334 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 PKN1Q16512 942 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 RUFY3Q7L099 469 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 NID2Q14112 1375 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 TET1Q8NFU7 2136 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 DLL1O00548 723 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 GNAT1P11488 350 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 MARK3P27448 753 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 ARHGAP4P98171 946 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 AP3B2Q13367 1082 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 ADGRE1Q14246 886 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 CEP55Q53EZ4 464 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 LMBR1Q8WVP7 490 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-211ENST00000482015 CTSHP09668 335 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 SREBF1P36956 1147 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 ADAM17P78536 824 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 DEFB103AP81534 67 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 NTRK3Q16288 839 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 USP38Q8NB14 1042 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 GLG1Q92896 1179 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 GBF1Q92538 1859 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 LGR5O75473 907 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 ARHGEF15O94989 841 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 IGFBP4P22692 258 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 ZNF76P36508 570 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 EVCP57679 992 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 IKBKEQ14164 716 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 PPM1EQ8WY54 764 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 OSBPL7Q9BZF2 842 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 CERS4Q9HA82 394 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 NRCAMQ92823 1304 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 UNC80Q8N2C7 3258 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 KIF28PB7ZC32 967 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 MEIS1O00470 390 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 TLL1O43897 1013 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 PPFIA1Q13136 1202 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 PCYT2Q99447 389 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 SDF4Q9BRK5 362 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 C6orf50Q9HD87 102 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 EMSYQ7Z589 1322 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 ESYT2A0FGR8 921 aa21.42■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 FAM86B1E9PN63 330 aa21.42■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 NFASCO94856 1347 aa21.42■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.42■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 IFNAR1P17181 557 aa21.42■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.42■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 UIMC1Q96RL1 719 aa21.42■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.42■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 A0A0C4DFX4 3053 aa21.42■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 RFXAPO00287 272 aa21.41■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 CAND2O75155 1236 aa21.41■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 ACTR2P61160 394 aa21.41■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 TAP1Q03518 808 aa21.41■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 GRIK4Q16099 956 aa21.41■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.41■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.41■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.41■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 LCHNA4D1U4 455 aa21.4■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 EFCAB14O75071 495 aa21.4■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 IGBP1P78318 339 aa21.4■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.4■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.4■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 SPRED2Q7Z698 418 aa21.4■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.4■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms