RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 BAIAP3O94812 1187 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SEMA3FQ13275 785 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 HIC1Q14526 733 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 KRT40Q6A162 431 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 BRF1Q92994 677 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TRPC6Q9Y210 931 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 LCHNA4D1U4 455 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TNFRSF10AO00220 468 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 PIK3CDO00329 1044 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 LGR5O75473 907 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 PARNO95453 639 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 AMHP03971 560 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 ITGB5P18084 799 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 ICAM3P32942 547 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TAP1Q03518 808 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 PPFIA1Q13136 1202 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TCTN1Q2MV58 587 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 XRRA1Q6P2D8 792 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.937e-7■■■■□ 22.4
CTPS1-209ENST00000480420 SPRED2Q7Z698 418 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SEPT8Q92599 483 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 GPRASP2Q96D09 838 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 CDHR1Q96JP9 859 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SDF4Q9BRK5 362 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 AZI2Q9H6S1 392 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 BACH1O14867 736 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGEF15O94989 841 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 REC8O95072 547 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 CSPG5O95196 566 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 CDC27P30260 824 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 PLA2G5P39877 138 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 MBTPS1Q14703 1052 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SERINC5Q86VE9 423 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 CYP2W1Q8TAV3 490 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 PHKBQ93100 1093 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 ANO3Q9BYT9 981 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 JADE2Q9NQC1 790 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 THEGQ9P2T0 379 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SLC9A2Q9UBY0 812 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SNX14Q9Y5W7 946 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 EMSYQ7Z589 1322 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 EPOPA6NHQ4 379 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 STXBP3O00186 592 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 ARP10275 920 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 GHRP10912 638 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 KCNA2P16389 499 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 PSMA5P28066 241 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 TFF2Q03403 129 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 STK3Q13188 491 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 GPNMBQ14956 572 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 GRIK4Q16099 956 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 RSPH3Q86UC2 560 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 GDPD5Q8WTR4 605 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 YME1L1Q96TA2 773 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 MXRA8Q9BRK3 442 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-209ENST00000480420 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa9.21□□□□□ -0.94
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