RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478603.5

C9orf3-216, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 802 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-216ENST00000478603 JADE2Q9NQC1 790 aa26.16■■□□□ 1.78
C9orf3-216ENST00000478603 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
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C9orf3-216ENST00000478603 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa26.15■■□□□ 1.78
C9orf3-216ENST00000478603 ARHGAP4P98171 946 aa26.15■■□□□ 1.78
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C9orf3-216ENST00000478603 KRT40Q6A162 431 aa26.14■■□□□ 1.78
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C9orf3-216ENST00000478603 THEGQ9P2T0 379 aa26.14■■□□□ 1.78
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C9orf3-216ENST00000478603 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
C9orf3-216ENST00000478603 SEPT8Q92599 483 aa26.09■■□□□ 1.77
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C9orf3-216ENST00000478603 LINC01553A4QN01 128 aa26.08■■□□□ 1.77
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C9orf3-216ENST00000478603 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.08■■□□□ 1.77
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C9orf3-216ENST00000478603 PCYT2Q99447 389 aa26.08■■□□□ 1.77
C9orf3-216ENST00000478603 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa26.08■■□□□ 1.77
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C9orf3-216ENST00000478603 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
C9orf3-216ENST00000478603 TUBE1Q9UJT0 475 aa26.06■■□□□ 1.76
C9orf3-216ENST00000478603 SCG2P13521 617 aa26.05■■□□□ 1.76
C9orf3-216ENST00000478603 SREBF1P36956 1147 aa26.05■■□□□ 1.76
C9orf3-216ENST00000478603 TFF2Q03403 129 aa26.05■■□□□ 1.76
C9orf3-216ENST00000478603 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
C9orf3-216ENST00000478603 AP3B2Q13367 1082 aa26.05■■□□□ 1.76
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