RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 MAD2L2Q9UI95 211 aa7.14□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 TBX21Q9UL17 535 aa7.14□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 ABCB11O95342 1321 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 ESPNB1AK53 854 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 CDKL5O76039 1030 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 CAVIN2O95810 425 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 CFBP00751 764 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 TIMP1P01033 207 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 CSF2RAP15509 400 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 CCL23P55773 120 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 ANTXR2P58335 489 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 WTAPQ15007 396 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 LY6KQ17RY6 165 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 DUSP28Q4G0W2 176 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 SPATA32Q96LK8 384 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 PIGSQ96S52 555 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 LRRC2Q9BYS8 371 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 WDR81Q562E7 1941 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 MROH7Q68CQ1 1323 aa7.13□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 GRXCR1A8MXD5 290 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 CPLX1O14810 134 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 OPLAHO14841 1288 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 PRC1O43663 620 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 ZEB2O60315 1214 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 B4GALT4O60513 344 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 CD4P01730 458 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 CCDC192P0DO97 292 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 TXNP10599 105 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 CYP2C9P11712 490 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 RXRAP19793 462 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 NT5C2P49902 561 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 APOBRQ0VD83 1088 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 RESTQ13127 1097 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 GRM4Q14833 912 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 PPP2R5BQ15173 497 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 ARHGEF16Q5VV41 709 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 TOX2Q96NM4 488 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 GUCD1Q96NT3 240 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 RMDN3Q96TC7 470 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 PHOX2BQ99453 314 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 ERICH2A1L162 156 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 JAK2O60674 1132 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 EDNRBP24530 442 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 MSNP26038 577 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 RCAN1P53805 252 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 PURAQ00577 322 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 SART3Q15020 963 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 TMEM240Q5SV17 173 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 MFSD5Q6N075 450 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 ZNF365Q70YC5 407 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 BRAPQ7Z569 592 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 DNERQ8NFT8 737 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 IL31RAQ8NI17 732 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 SCFD2Q8WU76 684 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 AFG1LQ8WV93 481 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 SCLYQ96I15 445 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 AMNQ9BXJ7 453 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 HIPK3Q9H422 1215 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 PXMP2Q9NR77 195 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.12□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 VCANP13611 3396 aa7.11□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.11□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.11□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 ZBTB5O15062 677 aa7.11□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 CYTH3O43739 400 aa7.11□□□□□ -1.27
MITF-215ENST00000478490 CABYRO75952 493 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms