RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 IGHA2P01877 340 aa29.1■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 KARSQ15046 597 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 MFSD14CQ5VZR4 134 aa29.1■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 NCAPH2Q6IBW4 605 aa29.1■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 PANK2Q9BZ23 570 aa29.1■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 UNC45AQ9H3U1 944 aa29.1■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 KRT79Q5XKE5 535 aa29.09■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 SNX29Q8TEQ0 813 aa29.09■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 NFASCO94856 1347 aa29.08■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 EML1O00423 815 aa29.08■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 CCDC183Q5T5S1 534 aa29.08■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 TRPV1Q8NER1 839 aa29.08■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 TIGD1Q96MW7 591 aa29.08■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 TINF2Q9BSI4 451 aa29.08■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa29.08■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 CLSTN2Q9H4D0 955 aa29.08■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 DISC1Q9NRI5 854 aa29.08■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa29.08■■■□□ 2.25
SOBP-202ENST00000477448 E2F4Q16254 413 aa29.07■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 LONRF3Q496Y0 759 aa29.07■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa29.07■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 SENP7Q9BQF6 1050 aa29.07■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 SDF4Q9BRK5 362 aa29.07■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 NUP62CLQ9H1M0 184 aa29.07■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 CCDC39Q9UFE4 941 aa29.07■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 STK24Q9Y6E0 443 aa29.07■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 CHMP2AO43633 222 aa29.06■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 TGFB3P10600 412 aa29.06■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 SP2Q02086 613 aa29.06■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 OLFML2BQ68BL8 750 aa29.06■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 DHX58Q96C10 678 aa29.06■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 CALML4Q96GE6 196 aa29.06■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 KATNBL1Q9H079 304 aa29.06■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 VTA1Q9NP79 307 aa29.06■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 SLC26A4O43511 780 aa29.05■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 HAUS3Q68CZ6 603 aa29.05■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 KCNV1Q6PIU1 500 aa29.05■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 KRBA2Q6ZNG9 492 aa29.05■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa29.05■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 RASSF8Q8NHQ8 419 aa29.05■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 ERMNQ8TAM6 284 aa29.05■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 SERTAD1Q9UHV2 236 aa29.05■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 CNGA1P29973 690 aa29.04■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 GRB10Q13322 594 aa29.04■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 HYIQ5T013 277 aa29.04■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 IQUBQ8NA54 791 aa29.04■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 PNMA5Q96PV4 448 aa29.04■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 USP25Q9UHP3 1055 aa29.04■■■□□ 2.24
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SOBP-202ENST00000477448 LHX8Q68G74 356 aa29.04■■■□□ 2.24
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SOBP-202ENST00000477448 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
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SOBP-202ENST00000477448 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa29.04■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 MED24O75448 989 aa29.03■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 STAT6P42226 847 aa29.03■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 EPHA7Q15375 998 aa29.03■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 CAMK4Q16566 473 aa29.03■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 ECM1Q16610 540 aa29.03■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 NAALADL2Q58DX5 795 aa29.03■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 TAPT1Q6NXT6 567 aa29.03■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa29.03■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 PLIN2Q99541 437 aa29.03■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
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SOBP-202ENST00000477448 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa29.03■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa29.02■■■□□ 2.24
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SOBP-202ENST00000477448 SLFN14P0C7P3 912 aa29.02■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 RPA1P27694 616 aa29.02■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 TMEM119Q4V9L6 283 aa29.02■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 CCDC62Q6P9F0 684 aa29.02■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 MIER3Q7Z3K6 550 aa29.02■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 CATSPER3Q86XQ3 398 aa29.02■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 LRRC15Q8TF66 581 aa29.02■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 SCFD2Q8WU76 684 aa29.02■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 TNMDQ9H2S6 317 aa29.02■■■□□ 2.24
SOBP-202ENST00000477448 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa29.02■■■□□ 2.24
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