RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 CD244Q9BZW8 370 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PCIF1Q9H4Z3 704 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 OXSMQ9NWU1 459 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 SPO11Q9Y5K1 396 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP17A1P05093 508 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.68□□□□□ -1.185e-13■□□□□ 9
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RABGGTB-205ENST00000462042 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 BTBD8Q5XKL5 378 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PHLDB1Q86UU1 1377 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 SCDO00767 359 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 KRT37O76014 449 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 KIF11P52732 1056 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 RGL3Q3MIN7 710 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 MIB1Q86YT6 1006 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 KIAA1958Q8N8K9 716 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ALG3Q92685 438 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 EMC7Q9NPA0 242 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 RIC8BQ9NVN3 520 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PEX10O60683 326 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 SDHAP31040 664 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 HERVK_113P62684 666 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR158Q5T848 1215 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 FERMT3Q86UX7 667 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 Q8N3U1 123 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 CLEC4DQ8WXI8 215 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 CEP89Q96ST8 783 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC5A4Q9NY91 659 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 DTLQ9NZJ0 730 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNK3O14649 394 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 FNTBP49356 437 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 GUCY2FP51841 1108 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 SESN3P58005 492 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PHC1P78364 1004 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 TMC6Q7Z403 805 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 NME9Q86XW9 330 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 DDX11Q96FC9 970 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF38Q9H0F5 515 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 SPTLC3Q9NUV7 552 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 TELO2Q9Y4R8 837 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 LTFP02788 710 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 FAHP16930 419 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 VIPR1P32241 457 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 LSP1P33241 339 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 TMPRSS15P98073 1019 aa7.64□□□□□ -1.19
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RABGGTB-205ENST00000462042 CPZQ66K79 652 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 IQSEC1Q6DN90 963 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF605Q86T29 641 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC5A5Q92911 643 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 E2F7Q96AV8 911 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 FOXP2O15409 715 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 PDGFRBP09619 1106 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 NCAM1P13591 858 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 ID4P47928 161 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 ADCY1Q08828 1119 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 LRRC32Q14392 662 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM132BQ14DG7 1078 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 DDB1Q16531 1140 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
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