RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-208ENST00000455631 EDAQ92838 391 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 MTMR8Q96EF0 704 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 MMP1P03956 469 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 NDUFV1P49821 464 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 NEDD9Q14511 834 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 CYFIP1Q7L576 1253 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 GPR20Q99678 358 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 KAT6AQ92794 2004 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 CHRNA1P02708 482 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 SDSP20132 328 aa26.9■■□□□ 1.9
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PTPRA-208ENST00000455631 PTPN5P54829 565 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 ADAM17P78536 824 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 SP4Q02446 784 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 PBXIP1Q96AQ6 731 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 KRT23Q9C075 422 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 MAD2L2Q9UI95 211 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM221A6NGB7 291 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 M0R296 226 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 IER5LQ5T953 404 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 PPP2R3CQ969Q6 453 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 PLVAPQ9BX97 442 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 KIAA1671Q9BY89 1806 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 TRIOO75962 3097 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 ICAM3P32942 547 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 TRAF1Q13077 416 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 ADAM15Q13444 863 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 LPIN1Q14693 890 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 RUFY4Q6ZNE9 571 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 TRIM67Q6ZTA4 783 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 PIGSQ96S52 555 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 EHMT1Q9H9B1 1298 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 TELO2Q9Y4R8 837 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 NRCAMQ92823 1304 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 FIBPO43427 364 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 STAM2O75886 525 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 TTC3P53804 2025 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 SEMA3FQ13275 785 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 CAMK1Q14012 370 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 TAF2Q6P1X5 1199 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
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PTPRA-208ENST00000455631 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 PLAGL2Q9UPG8 496 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 ENPP3O14638 875 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 PRRX2Q99811 253 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 LNPKQ9C0E8 428 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.85■■□□□ 1.89
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PTPRA-208ENST00000455631 DGKIO75912 1065 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 EYA4O95677 639 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 MGAT3Q09327 533 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 SLC35G1Q2M3R5 365 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 RSPH3Q86UC2 560 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
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PTPRA-208ENST00000455631 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 SEC23AQ15436 765 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 PKN1Q16512 942 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 SMRP1Q8NCR6 262 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 P2RX5Q93086 422 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 DSCC1Q9BVC3 393 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 CLEC1BQ9P126 229 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRA-208ENST00000455631 ST18O60284 1047 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 ITGB1P05556 798 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 DNAJB1P25685 340 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
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PTPRA-208ENST00000455631 PPFIA1Q13136 1202 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 FBXO47Q5MNV8 452 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 RIOX1Q9H6W3 641 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 TUBE1Q9UJT0 475 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 MARK3P27448 753 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 TCF15Q12870 199 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 GRM4Q14833 912 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 EFHBQ8N7U6 833 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 DNAJB3Q8WWF6 145 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 CDY2AQ9Y6F7 541 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 LOC730098B7Z3J9 87 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PTPRA-208ENST00000455631 NRIP1P48552 1158 aa26.8■■□□□ 1.88
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