RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438964.6

ACTN1-204, Transcript of actinin alpha 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN1, Length 3,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-204ENST00000438964 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTN1-204ENST00000438964 USP54Q70EL1 1684 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN1-204ENST00000438964 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN1-204ENST00000438964 MYH1P12882 1939 aa14.65□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 OR52Z1P0C646 297 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 NAPAP54920 295 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 PTK2Q05397 1052 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 CENPPQ6IPU0 288 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 GJB7Q6PEY0 223 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 MREGQ8N565 214 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 CUL5Q93034 780 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 MYH4Q9Y623 1939 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 PJA2O43164 708 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 SMIM5Q71RC9 77 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 PSMD1Q99460 953 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 BCS1LQ9Y276 419 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 DDAH1O94760 285 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 KIF4AO95239 1232 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 LCA5LO95447 670 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 CALM1P0DP23 149 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 CALM2P0DP24 149 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 CALM3P0DP25 149 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 PLCB4Q15147 1175 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 FIGNQ5HY92 759 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 SV2BQ7L1I2 683 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 AZI2Q9H6S1 392 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 SLC9A1P19634 815 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 ABCB4P21439 1286 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 CALML3P27482 149 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 PRDX5P30044 214 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 EPS15P42566 896 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 PLTPP55058 493 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 TBCKQ8TEA7 893 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 DDX12PQ92771 950 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 MGRN1O60291 552 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 RTN2O75298 545 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 STARD3NLO95772 234 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 XRCC4Q13426 336 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 SNX24Q9Y343 169 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 TDP2O95551 362 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 GRB10Q13322 594 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 CRYMQ14894 314 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 SLC18A3Q16572 532 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 LRRC45Q96CN5 670 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 ZNF570Q96NI8 536 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 PNMA3Q9UL41 463 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 F8VZ95 297 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 ORC4O43929 436 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 UBOX5O94941 541 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 FGGP02679 453 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 SERPING1P05155 500 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 PPP2R5BQ15173 497 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 ECM1Q16610 540 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 CALML4Q96GE6 196 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 PPIP5K2O43314 1243 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-204ENST00000438964 SLC37A4O43826 429 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms