RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437652.5

UBAP2L-209, Transcript of ubiquitin associated protein 2 like, humanhuman

TSL 3

Gene UBAP2L, Length 911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2L-209ENST00000437652 BRPF3Q9ULD4 1205 aa29.95■■■□□ 2.39
UBAP2L-209ENST00000437652 V9GY48 417 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
UBAP2L-209ENST00000437652 LCHNA4D1U4 455 aa29.94■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 AMHP03971 560 aa29.94■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 KCNA2P16389 499 aa29.94■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 NAPAP54920 295 aa29.94■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 ADCK5Q3MIX3 580 aa29.94■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 PKD2L1Q9P0L9 805 aa29.94■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 NRCAMQ92823 1304 aa29.94■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 FGD1P98174 961 aa29.93■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa29.93■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 WWC2Q6AWC2 1192 aa29.93■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP29.93■■■□□ 2.382e-10■■■■■ 36.4
UBAP2L-209ENST00000437652 SEPT8Q92599 483 aa29.93■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 TTC28Q96AY4 2481 aa29.93■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa29.92■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 CTSHP09668 335 aa29.92■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 GLG1Q92896 1179 aa29.92■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 INSL6Q9Y581 213 aa29.92■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 FOSP01100 380 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 GRB10Q13322 594 aa29.91■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 MYOCDQ8IZQ8 938 aa29.91■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 LMBR1Q8WVP7 490 aa29.91■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa29.91■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 RIC8AQ9NPQ8 531 aa29.91■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 ERAP1Q9NZ08 941 aa29.91■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa29.91■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa29.9■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 GOLGA8AA7E2F4 631 aa29.9■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 GOLGA8BA8MQT2 603 aa29.9■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 ADAM17P78536 824 aa29.9■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 KRT40Q6A162 431 aa29.9■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 TEX2Q8IWB9 1127 aa29.9■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 MXRA8Q9BRK3 442 aa29.9■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 SMCO2A6NFE2 343 aa29.89■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 ADCY7P51828 1080 aa29.89■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 AAK1Q2M2I8 961 aa29.89■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 PPP1R18Q6NYC8 613 aa29.89■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 SPRED2Q7Z698 418 aa29.89■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 GLT8D2Q9H1C3 349 aa29.89■■■□□ 2.38
UBAP2L-209ENST00000437652 MICAL3Q7RTP6 2002 aa29.88■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa29.88■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 hCG_1984214I3L0E3 225 aa29.88■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 MARK3P27448 753 aa29.88■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 ERVK-21P61565 698 aa29.88■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 FUT2Q10981 343 aa29.88■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 PPFIA1Q13136 1202 aa29.88■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 FAM26DQ5JW98 314 aa29.88■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 RSPH3Q86UC2 560 aa29.88■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 KCNH7Q9NS40 1196 aa29.88■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 MTUS1Q9ULD2 1270 aa29.88■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 LINC01553A4QN01 128 aa29.87■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 TNFRSF10AO00220 468 aa29.87■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 TYW1BQ6NUM6 668 aa29.87■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 TAF2Q6P1X5 1199 aa29.87■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.87■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 LMCD1Q9NZU5 365 aa29.87■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa29.86■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 STXBP3O00186 592 aa29.86■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 LPXNO60711 386 aa29.86■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa29.86■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 APBB2Q92870 758 aa29.86■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 PGBD1Q96JS3 809 aa29.86■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 SDF4Q9BRK5 362 aa29.86■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 OSBPL7Q9BZF2 842 aa29.86■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 AZI2Q9H6S1 392 aa29.86■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 BARHL2Q9NY43 387 aa29.86■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 SLC9A2Q9UBY0 812 aa29.86■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 CDC27P30260 824 aa29.85■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 ZNF76P36508 570 aa29.85■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 RCAN1P53805 252 aa29.85■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 GRIK4Q16099 956 aa29.85■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 CYP2W1Q8TAV3 490 aa29.85■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 ANO3Q9BYT9 981 aa29.85■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 SUGCTQ9HAC7 445 aa29.85■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 COG5Q9UP83 839 aa29.85■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 REV3LO60673 3130 aa29.85■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 UPP2O95045 317 aa29.84■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 CHRNA1P02708 482 aa29.84■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 ADD1P35611 737 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 TFF2Q03403 129 aa29.84■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 CEP55Q53EZ4 464 aa29.84■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 RUFY4Q6ZNE9 571 aa29.84■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 Q6ZUG5 572 aa29.84■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 RPAINQ86UA6 219 aa29.84■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 GDPD5Q8WTR4 605 aa29.84■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 TOP1MTQ969P6 601 aa29.84■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 RRN3P2A6NIE6 340 aa29.83■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 CPA1P15085 419 aa29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms