RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436280.5

GPN1-204, Transcript of GPN-loop GTPase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPN1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN1-204ENST00000436280 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa15.98■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 NIPA1Q7RTP0 329 aa15.98■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 TRIM50Q86XT4 487 aa15.98■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 KAT6AQ92794 2004 aa15.98■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 VWCEQ96DN2 955 aa15.98■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 RNPEPQ9H4A4 650 aa15.98■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 ZNF576Q9H609 170 aa15.98■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 SH3GLB2Q9NR46 395 aa15.98■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 ERAP1Q9NZ08 941 aa15.98■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 SLC9A2Q9UBY0 812 aa15.98■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 MYO9BQ13459 2157 aa15.97■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 EMSYQ7Z589 1322 aa15.97■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 NRCAMQ92823 1304 aa15.97■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 MEIS1O00470 390 aa15.97■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 CAND2O75155 1236 aa15.97■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 CYP2W1Q8TAV3 490 aa15.97■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa15.97■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 GLG1Q92896 1179 aa15.97■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 SLC9A7Q96T83 725 aa15.97■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa15.97■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 AZI2Q9H6S1 392 aa15.97■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 TREHO43280 583 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 DEXIO95424 95 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 CXCL10P02778 98 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 CYP3A4P08684 503 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 THPOP40225 353 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 PBX2P40425 430 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 KCNJ6P48051 423 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 SETQ01105 290 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 HIC1Q14526 733 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 ANKRD1Q15327 319 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 TET1Q8NFU7 2136 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 SLC28A3Q9HAS3 691 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 SETD4Q9NVD3 440 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 TELO2Q9Y4R8 837 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa15.96■□□□□ 0.15
GPN1-204ENST00000436280 RSPH10B2B2RC85 870 aa15.95■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 EFCAB14O75071 495 aa15.95■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 PPFIA3O75145 1194 aa15.95■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 CDKL5O76039 1030 aa15.95■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 RSPH10BP0C881 870 aa15.95■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 ARP10275 920 aa15.95■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 NLRP5P59047 1200 aa15.95■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 STK3Q13188 491 aa15.95■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15.95■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 LMBR1Q8WVP7 490 aa15.95■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 CRYGNQ8WXF5 182 aa15.95■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 WNT8BQ93098 351 aa15.95■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 KIF28PB7ZC32 967 aa15.94■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 FAM86B1E9PN63 330 aa15.94■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 NBNO60934 754 aa15.94■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 LGR5O75473 907 aa15.94■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 FAM86B2P0C5J1 330 aa15.94■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 FOSL2P15408 326 aa15.94■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 ACTR2P61160 394 aa15.94■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 PPFIA1Q13136 1202 aa15.94■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 TAF2Q6P1X5 1199 aa15.94■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 MYLIPQ8WY64 445 aa15.94■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 C22orf23Q9BZE7 217 aa15.94■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa15.94■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 WDR81Q562E7 1941 aa15.94■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.93■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 MARK3P27448 753 aa15.93■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 SLC26A2P50443 739 aa15.93■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 RABGGTBP53611 331 aa15.93■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 ADAM17P78536 824 aa15.93■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 IKBKEQ14164 716 aa15.93■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 GPNMBQ14956 572 aa15.93■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 GRIN2CQ14957 1233 aa15.93■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 TRAF7Q6Q0C0 670 aa15.93■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa15.93■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 SLC17A8Q8NDX2 589 aa15.93■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 ZNF577Q9BSK1 485 aa15.93■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa15.93■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.93■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 PTPRSQ13332 1948 aa15.93■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa15.92■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 RRN3P2A6NIE6 340 aa15.92■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 STAT5BP51692 787 aa15.92■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 WDR5P61964 334 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 GRIK4Q16099 956 aa15.92■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 PPP2R2DQ66LE6 453 aa15.92■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 GALNT17Q6IS24 598 aa15.92■□□□□ 0.14
GPN1-204ENST00000436280 RSPH3Q86UC2 560 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms