RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431283.1

PTPN4-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-204	ENST00000431283	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	NTRK3	Q16288	839 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	MTERF2	Q49AM1	385 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	DTX3	Q8N9I9	347 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	AQP7	O14520	342 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	GLRB	P48167	497 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	PHF19	Q5T6S3	580 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	KCTD1	Q719H9	257 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	7.29	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	PDPK1	O15530	556 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	LTF	P02788	710 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF20	P17024	532 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	ATP2B1	P20020	1258 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	PAK1	Q13153	545 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	MBD6	Q96DN6	1003 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	IPPK	Q9H8X2	491 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	WASF3	Q9UPY6	502 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	NAT1	P18440	290 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	PFKP	Q01813	784 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	CD276	Q5ZPR3	534 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	SLFN13	Q68D06	897 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	DEF6	Q9H4E7	631 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	EPHB4	P54760	987 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	ST5	P78524	1137 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283		Q6ZUG5	572 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	PROSER1	Q86XN7	944 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	STPG3	Q8N7X2	389 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	NUDT11	Q96G61	164 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283		H0Y858	1186 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	GSTA4	O15217	222 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	EPHA5	P54756	1037 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	RASGRF1	Q13972	1273 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	SPATC1	Q76KD6	591 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	PTPRN2	Q92932	1015 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	NBPF4	Q96M43	638 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	CD244	Q9BZW8	370 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF839	A8K0R7	811 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	KLHL18	O94889	574 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	KNG1	P01042	644 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	GUCY1A3	Q02108	690 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	FBXW5	Q969U6	566 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	COL6A1	P12109	1028 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	ICAM4	Q14773	271 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	GPR19	Q15760	415 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	HS1BP3	Q53T59	392 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	KLC2	Q9H0B6	622 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	ASXL2	Q76L83	1435 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	KRT15	P19012	456 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	TNFRSF1A	P19438	455 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	GJA4	P35212	333 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPN4-204	ENST00000431283	ZXDA	P98168	799 aa		7.23	□□□□□ -1.25

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