RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		12.49	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		12.49	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	AZI2	Q9H6S1	392 aa		12.49	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		12.49	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF286B	P0CG31	522 aa		12.49	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	ACTN1	P12814	892 aa		12.49	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		12.49	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		12.48	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		12.48	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	PTGS1	P23219	599 aa		12.48	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	SFN	P31947	248 aa		12.48	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	HERVK_113	Q902F9	699 aa		12.48	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		12.48	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	TBX3	O15119	743 aa		12.48	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	EFCAB14	O75071	495 aa		12.48	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		12.48	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		12.48	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	JAK3	P52333	1124 aa		12.48	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		12.48	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	ATP9A	O75110	1047 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	AR	P10275	920 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	ACTR2	P61160	394 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	NPY5R	Q15761	445 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC5A5	Q92911	643 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	PGBD1	Q96JS3	809 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	WDR81	Q562E7	1941 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM86B1	E9PN63	330 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	BAIAP3	O94812	1187 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	PSAP	P07602	524 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	SELP	P16109	830 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	SERINC5	Q86VE9	423 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	TBCK	Q8TEA7	893 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM167A	Q96KS9	214 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		12.47	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	RASIP1	Q5U651	963 aa		12.46	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		12.46	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	NEK8	Q86SG6	692 aa		12.46	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM20A	Q96MK3	541 aa		12.46	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	LARGE1	O95461	756 aa		12.46	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	MMP1	P03956	469 aa		12.46	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM26D	Q5JW98	314 aa		12.46	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		12.46	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	RSPH3	Q86UC2	560 aa		12.46	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	PPME1	Q9Y570	386 aa		12.46	□□□□□ -0.41
UBXN7-205	ENST00000429160	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	12.46	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	FGB	P02675	491 aa		12.46	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	12.46	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		12.46	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	NECAB1	Q8N987	351 aa		12.46	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	KAT6A	Q92794	2004 aa		12.46	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	WDR64	B1ANS9	1081 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	IQCF3	P0C7M6	154 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	ITGB8	P26012	769 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	PRR16	Q569H4	304 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	GLG1	Q92896	1179 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	LENG9	Q96B70	501 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	HBP1	O60381	514 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	CXCL10	P02778	98 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	CYP2C18	P33260	490 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	STAT5B	P51692	787 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	ADAM17	P78536	824 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	TMEM240	Q5SV17	173 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF302	Q9NR11	478 aa		12.45	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC34A2	O95436	690 aa		12.44	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	PPFIA1	Q13136	1202 aa		12.44	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		12.44	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	TNFRSF25	Q93038	417 aa		12.44	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	BACH2	Q9BYV9	841 aa		12.44	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		12.44	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		12.44	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		12.44	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	BRCA2	P51587	3418 aa		12.44	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	SHH	Q15465	462 aa		12.44	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	NME8	Q8N427	588 aa		12.44	□□□□□ -0.42
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		12.44	□□□□□ -0.42

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms