RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP7.78□□□□□ -1.16
HOXD8-202ENST00000429017 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
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HOXD8-202ENST00000429017 B4GALT4O60513 344 aa7.77□□□□□ -1.17
HOXD8-202ENST00000429017 IL2RAP01589 272 aa7.77□□□□□ -1.17
HOXD8-202ENST00000429017 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
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HOXD8-202ENST00000429017 TSPY8P0CW00 308 aa7.77□□□□□ -1.17
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HOXD8-202ENST00000429017 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
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HOXD8-202ENST00000429017 HIPK3Q9H422 1215 aa7.76□□□□□ -1.17
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HOXD8-202ENST00000429017 ARAFP10398 606 aa7.74□□□□□ -1.17
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HOXD8-202ENST00000429017 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
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HOXD8-202ENST00000429017 NSMFQ6X4W1 530 aa7.74□□□□□ -1.17
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HOXD8-202ENST00000429017 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.74□□□□□ -1.17
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HOXD8-202ENST00000429017 MSRAQ9UJ68 235 aa7.74□□□□□ -1.17
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HOXD8-202ENST00000429017 STX8Q9UNK0 236 aa7.74□□□□□ -1.17
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HOXD8-202ENST00000429017 ICAM1P05362 532 aa7.74□□□□□ -1.17
HOXD8-202ENST00000429017 CYP2C9P11712 490 aa7.74□□□□□ -1.17
HOXD8-202ENST00000429017 FGFR3P22607 806 aa7.74□□□□□ -1.17
HOXD8-202ENST00000429017 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
HOXD8-202ENST00000429017 CENPCQ03188 943 aa7.74□□□□□ -1.17
HOXD8-202ENST00000429017 MYO9BQ13459 2157 aa7.74□□□□□ -1.17
HOXD8-202ENST00000429017 TTLL4Q14679 1199 aa7.74□□□□□ -1.17
HOXD8-202ENST00000429017 RAB30Q15771 203 aa7.74□□□□□ -1.17
HOXD8-202ENST00000429017 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.74□□□□□ -1.17
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