RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 AP5M1Q9H0R1 490 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 WDR64B1ANS9 1081 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 EML1O00423 815 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 SFNP31947 248 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 JAK3P52333 1124 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 ACTR2P61160 394 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 SPECC1Q5M775 1068 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 AK8Q96MA6 479 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 DISC1Q9NRI5 854 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 Q9Y3F1 56 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 PP2D1A8MPX8 630 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 ERMNQ8TAM6 284 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 AFG1LQ8WV93 481 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 UNC93B1Q9H1C4 597 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 MSCO60682 206 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 CDC25AP30304 524 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 ADALQ6DHV7 355 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 PPTC7Q8NI37 304 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 GPR20Q99678 358 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 MTFR1Q15390 333 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 RDM1Q8NG50 284 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 SPC25Q9HBM1 224 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 CAPN15O75808 1086 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 PSAPP07602 524 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 CCL5P13501 91 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 TXLNAP40222 546 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 UBA7P41226 1012 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 EPHA7Q15375 998 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 KRT79Q5XKE5 535 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 SHC4Q6S5L8 630 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 EPSTI1Q96J88 318 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 RNF208Q9H0X6 261 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-202ENST00000428284 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 POTEFA5A3E0 1075 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 PGK1P00558 417 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 CPT1AP50416 773 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 USP49Q70CQ1 688 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 ARMC5Q96C12 935 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF333Q96JL9 665 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 STK24Q9Y6E0 443 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 BACH1O14867 736 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 MMP3P08254 477 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 GJA9P57773 515 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 CYP4A11Q02928 519 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 CABP7Q86V35 215 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1W2PQ27 194 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1W2PQ64 194 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1W2PQD8 194 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 ATG7O95352 703 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 BEX3Q00994 111 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 RESP18Q5W5W9 173 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 BANK1Q8NDB2 785 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 DYDC2Q96IM9 177 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 FAM13BQ9NYF5 915 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 RGL1Q9NZL6 768 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 KAT6AQ92794 2004 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 MYADML2A6NDP7 307 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 A6NJR5 290 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 CMA1P23946 247 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 DGKDQ16760 1214 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.11■■□□□ 1.29
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