RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 RPAINQ86UA6 219 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 SETD4Q9NVD3 440 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 TNFRSF10AO00220 468 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 LPXNO60711 386 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 CDC45O75419 566 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 AMHP03971 560 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 ERVK-21P61565 698 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 FUT2Q10981 343 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 GRB10Q13322 594 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 AAK1Q2M2I8 961 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 SEPT1Q8WYJ6 367 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 JADE2Q9NQC1 790 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB43O43298 467 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP4P98171 946 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 SP4Q02446 784 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.446e-12■■■■■ 38.1
LIMS1-208ENST00000428064 SPRED2Q7Z698 418 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 SEPT8Q92599 483 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 APBB2Q92870 758 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 ERAP1Q9NZ08 941 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 INSL6Q9Y581 213 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01553A4QN01 128 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 RTN1Q16799 776 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 SKAP1Q86WV1 359 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 RASEFQ8IZ41 740 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 RIC8AQ9NPQ8 531 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 COG5Q9UP83 839 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 FOSP01100 380 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.03■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 IL27Q8NEV9 243 aa24.03■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 KAT6AQ92794 2004 aa24.02■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 CTSHP09668 335 aa24.02■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 NAPAP54920 295 aa24.02■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 KRT40Q6A162 431 aa24.02■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.02■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.02■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.02■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 GLT8D2Q9H1C3 349 aa24.02■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa24.02■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 PPFIA1Q13136 1202 aa24.01■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 AP3B2Q13367 1082 aa24.01■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 KCNB2Q92953 911 aa24.01■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 TOP1MTQ969P6 601 aa24.01■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.01■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.01■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 KCNH7Q9NS40 1196 aa24.01■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 BARHL2Q9NY43 387 aa24.01■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 NFASCO94856 1347 aa24.01■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 STXBP3O00186 592 aa24■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 BMP1P13497 986 aa24■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 GDPD5Q8WTR4 605 aa24■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 SLC9A2Q9UBY0 812 aa24■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 TUBE1Q9UJT0 475 aa24■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 NID2Q14112 1375 aa24■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.99■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.99■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.99■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 ADCY7P51828 1080 aa23.99■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 TFF2Q03403 129 aa23.99■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 MGAT3Q09327 533 aa23.99■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 GRIK4Q16099 956 aa23.99■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.99■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 RSPH3Q86UC2 560 aa23.99■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 GLG1Q92896 1179 aa23.99■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 SAMD11Q96NU1 681 aa23.99■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 CHRNA1P02708 482 aa23.98■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 CDC27P30260 824 aa23.98■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 SREBF1P36956 1147 aa23.98■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 CEP55Q53EZ4 464 aa23.98■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 MARCH8Q5T0T0 291 aa23.98■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.98■■□□□ 1.43
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