RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 ITKQ08881 620 aa15.68■□□□□ 0.1
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PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa15.68■□□□□ 0.1
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PTPRU-204ENST00000428026 CHUKO15111 745 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRU-204ENST00000428026 INPP1P49441 399 aa15.66■□□□□ 0.1
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PTPRU-204ENST00000428026 KRT80Q6KB66 452 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRU-204ENST00000428026 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PTPRU-204ENST00000428026 DYDC2Q96IM9 177 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRU-204ENST00000428026 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PTPRU-204ENST00000428026 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
PTPRU-204ENST00000428026 ZBTB17Q13105 803 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRU-204ENST00000428026 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.65■□□□□ 0.1
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