RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.27■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PPP2R2DQ66LE6 453 aa15.27■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RUFY3Q7L099 469 aa15.27■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PGBD1Q96JS3 809 aa15.27■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PRDM12Q9H4Q4 367 aa15.27■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KCNH7Q9NS40 1196 aa15.27■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SETD4Q9NVD3 440 aa15.27■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EMSYQ7Z589 1322 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NRCAMQ92823 1304 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ESYT2A0FGR8 921 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RSPH10B2B2RC85 870 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EFCAB14O75071 495 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CAND2O75155 1236 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RSPH10BP0C881 870 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF76P36508 570 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SREBF1P36956 1147 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IKBKEQ14164 716 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CEP55Q53EZ4 464 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MCTP2Q6DN12 878 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRAF7Q6Q0C0 670 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HERC6Q8IVU3 1022 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SDF4Q9BRK5 362 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMEM260Q9NX78 707 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ERAP1Q9NZ08 941 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 COL6A3P12111 3177 aa15.26■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TANC1Q9C0D5 1861 aa15.25■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LGR5O75473 907 aa15.25■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EVCP57679 992 aa15.25■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 WDR5P61964 334 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARHGAP4P98171 946 aa15.25■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PKN1Q16512 942 aa15.25■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa15.25■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CYP2W1Q8TAV3 490 aa15.25■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GLG1Q92896 1179 aa15.25■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PHKBQ93100 1093 aa15.25■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TM6SF1Q9BZW5 370 aa15.25■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C6orf50Q9HD87 102 aa15.25■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC9A2Q9UBY0 812 aa15.25■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SCN5AQ14524 2016 aa15.24■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NFASCO94856 1347 aa15.24■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MEIS1O00470 390 aa15.24■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CA3P07451 260 aa15.24■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARP10275 920 aa15.24■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IFNAR1P17181 557 aa15.24■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MARK3P27448 753 aa15.24■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GNA11P29992 359 aa15.24■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCT2P78371 535 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ADAM17P78536 824 aa15.24■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MBTPS1Q14703 1052 aa15.24■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NTRK3Q16288 839 aa15.24■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NIPA1Q7RTP0 329 aa15.24■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LMBR1Q8WVP7 490 aa15.24■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.24■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DLL1O00548 723 aa15.23■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TLL1O43897 1013 aa15.23■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IGFBP4P22692 258 aa15.23■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DEFB103AP81534 67 aa15.23■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PPFIA1Q13136 1202 aa15.23■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TCTN1Q2MV58 587 aa15.23■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BICD2Q8TD16 824 aa15.23■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.23■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AZI2Q9H6S1 392 aa15.23■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CYP3A4P08684 503 aa15.22■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CTSHP09668 335 aa15.22■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ACTR2P61160 394 aa15.22■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ADGRE1Q14246 886 aa15.22■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GRIK4Q16099 956 aa15.22■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa15.22■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TAF2Q6P1X5 1199 aa15.22■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RPAINQ86UA6 219 aa15.22■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15.22■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCDC148Q8NFR7 591 aa15.22■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DBF4BQ8NFT6 615 aa15.22■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SEPT8Q92599 483 aa15.22■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RRN3P2A6NIE6 340 aa15.21■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM86B1E9PN63 330 aa15.21■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PPFIA3O75145 1194 aa15.21■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM86B2P0C5J1 330 aa15.21■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TAP1Q03518 808 aa15.21■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM26DQ5JW98 314 aa15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms