RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP17L1Q7RTZ2 530 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 HAPLN4Q86UW8 402 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM126BQ8IXS8 530 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 CFAP44Q96MT7 982 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM209Q96SK2 561 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR11Q9BZH6 1224 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNH6Q9H252 994 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 GP6Q9HCN6 339 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 NRIP3Q9NQ35 241 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 TJP2Q9UDY2 1190 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 MCM8Q9UJA3 840 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTPN22Q9Y2R2 807 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM221BA6H8Z2 402 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 DRGXA6NNA5 263 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 RECQL4O94761 1208 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 ESRRBO95718 433 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 LDLRP01130 860 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 FUCA1P04066 466 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRKCGP05129 697 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 CKMP06732 381 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT5P13647 590 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 LAG3P18627 525 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCP2P22307 547 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRK4P32298 578 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 JAM2P57087 298 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 NKX3-2P78367 333 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 BLOC1S1P78537 153 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAM15Q13444 863 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 INPP5AQ14642 412 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC1A5Q15758 541 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPY5RQ15761 445 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 CR1LQ2VPA4 569 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 C8orf34Q49A92 452 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 CEP85LQ5SZL2 805 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 PI16Q6UXB8 463 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP2R1Q6VVX0 501 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 NR2C2APQ86WQ0 139 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 AEBP1Q8IUX7 1158 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 GALNT12Q8IXK2 581 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAT16Q8N8M0 369 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLPPR2Q96GM1 343 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM87BQ96K49 555 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 LMLNQ96KR4 655 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLITRK1Q96PX8 696 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM79Q9BSE2 394 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCTN5Q9BTE1 182 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 CBX8Q9HC52 389 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABCB6Q9NP58 842 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 STIM2Q9P246 746 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 NR2E1Q9Y466 385 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 TENM1Q9UKZ4 2725 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 XDHP47989 1333 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZMYND10O75800 440 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 UMODP07911 640 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 GM2AP17900 193 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 CFHR1Q03591 330 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDE4DQ08499 809 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 MPP3Q13368 585 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNC3Q14003 757 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 LLGL1Q15334 1064 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF585BQ52M93 769 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZMAT1Q5H9K5 638 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 WWC2Q6AWC2 1192 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGEF19Q8IW93 802 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 LYG1Q8N1E2 194 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 CFHR4Q92496 578 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 EDEM1Q92611 657 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 MIEF2Q96C03 454 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYEOVQ96EZ4 313 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 CARD11Q9BXL7 1154 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR87Q9BY21 358 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEMA4CQ9C0C4 833 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLK15Q9H2R5 256 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 AP5S1Q9NUS5 200 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms