RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 MCTP1Q6DN14 999 aa23.56■■□□□ 1.36
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C4orf48-201ENST00000409248 TBCKQ8TEA7 893 aa23.56■■□□□ 1.36
C4orf48-201ENST00000409248 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.56■■□□□ 1.36
C4orf48-201ENST00000409248 TRPV6Q9H1D0 765 aa23.56■■□□□ 1.36
C4orf48-201ENST00000409248 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.56■■□□□ 1.36
C4orf48-201ENST00000409248 A0A1W2PPC1 479 aa23.55■■□□□ 1.36
C4orf48-201ENST00000409248 H3BRB1 525 aa23.55■■□□□ 1.36
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C4orf48-201ENST00000409248 STX6O43752 255 aa23.55■■□□□ 1.36
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C4orf48-201ENST00000409248 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.54■■□□□ 1.36
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C4orf48-201ENST00000409248 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.52■■□□□ 1.36
C4orf48-201ENST00000409248 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.52■■□□□ 1.36
C4orf48-201ENST00000409248 MTMR6Q9Y217 621 aa23.52■■□□□ 1.36
C4orf48-201ENST00000409248 EMSYQ7Z589 1322 aa23.52■■□□□ 1.36
C4orf48-201ENST00000409248 KIF28PB7ZC32 967 aa23.51■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 ITGB8P26012 769 aa23.51■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 ACTR2P61160 394 aa23.51■■□□□ 1.35
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C4orf48-201ENST00000409248 PTGISQ16647 500 aa23.51■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 INF2Q27J81 1249 aa23.51■■□□□ 1.35
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C4orf48-201ENST00000409248 NEK8Q86SG6 692 aa23.51■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.51■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.51■■□□□ 1.35
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C4orf48-201ENST00000409248 TANC1Q9C0D5 1861 aa23.51■■□□□ 1.35
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C4orf48-201ENST00000409248 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.5■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.5■■□□□ 1.35
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C4orf48-201ENST00000409248 CYP2C9P11712 490 aa23.49■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 CYP3A7P24462 503 aa23.49■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 KRT76Q01546 638 aa23.49■■□□□ 1.35
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C4orf48-201ENST00000409248 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 TDHQ8IZJ6 230 aa23.49■■□□□ 1.35
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C4orf48-201ENST00000409248 TDP2O95551 362 aa23.48■■□□□ 1.35
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C4orf48-201ENST00000409248 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.48■■□□□ 1.35
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C4orf48-201ENST00000409248 EDIL3O43854 480 aa23.47■■□□□ 1.35
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C4orf48-201ENST00000409248 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 MBOAT7Q96N66 472 aa23.47■■□□□ 1.35
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C4orf48-201ENST00000409248 CCNE2O96020 404 aa23.46■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
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