RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388782.8

GKAP1-204, Transcript of G kinase anchoring protein 1, human

TSL 2

Gene GKAP1, Length 1,231 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GKAP1-204	ENST00000388782	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	WDR64	B1ANS9	1081 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	27.9	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	JAK3	P52333	1124 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	ACTR2	P61160	394 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	GPR20	Q99678	358 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	SGPL1	O95470	568 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	CCNE2	O96020	404 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	MMP3	P08254	477 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	GJA8	P48165	433 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	DGKD	Q16760	1214 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	FERMT2	Q96AC1	680 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	POTEF	A5A3E0	1075 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	CTAGE5	O15320	804 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	CHMP2A	O43633	222 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	KPNA6	O60684	536 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	LRRC41	Q15345	812 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	SPTLC2	O15270	562 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	PPFIA4	O75335	1185 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	TEC	P42680	631 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	DISC1	Q9NRI5	854 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	SAMM50	Q9Y512	469 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	MYADML2	A6NDP7	307 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	KBTBD13	C9JR72	458 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	DNM1L	O00429	736 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	PPP6R2	O75170	966 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	ATG7	O95352	703 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	PSAP	P07602	524 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	BEX3	Q00994	111 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	PDIA5	Q14554	519 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	STK24	Q9Y6E0	443 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	SPATA32	Q96LK8	384 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	EMSY	Q7Z589	1322 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	POTEM	A6NI47	508 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	ERMN	Q8TAM6	284 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	NEK9	Q8TD19	979 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	AK8	Q96MA6	479 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	AZI2	Q9H6S1	392 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	EPHA7	Q15375	998 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	KCNA10	Q16322	511 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	IL17A	Q16552	155 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
GKAP1-204	ENST00000388782	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GKAP1-204	ENST00000388782	EML1	O00423	815 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GKAP1-204	ENST00000388782	BACH1	O14867	736 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GKAP1-204	ENST00000388782	LGR5	O75473	907 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GKAP1-204	ENST00000388782	CABYR	O75952	493 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GKAP1-204	ENST00000388782	LGALS2	P05162	132 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GKAP1-204	ENST00000388782	MYL3	P08590	195 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GKAP1-204	ENST00000388782	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GKAP1-204	ENST00000388782	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GKAP1-204	ENST00000388782	ASGR1	P07306	291 aa		27.81	■■■□□ 2.04
GKAP1-204	ENST00000388782	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04

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