RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 MAP4K2Q12851 820 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-204ENST00000367379 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-204ENST00000367379 Q8N1X5 172 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-204ENST00000367379 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-204ENST00000367379 KLC2Q9H0B6 622 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-204ENST00000367379 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-204ENST00000367379 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.59□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 MAPKBP1O60336 1514 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 KIF13AQ9H1H9 1805 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 MAFKO60675 156 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 FSHBP01225 129 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRC-204ENST00000367379 TACR2P21452 398 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRC-204ENST00000367379 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRC-204ENST00000367379 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 GPR27Q9NS67 375 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 RBPJLQ9UBG7 517 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRC-204ENST00000367379 SLFN13Q68D06 897 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRC-204ENST00000367379 VPS37DQ86XT2 251 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRC-204ENST00000367379 GJB6O95452 261 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRC-204ENST00000367379 DTX3Q8N9I9 347 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 PTPN18Q99952 460 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 IQGAP2Q13576 1575 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 A0A1W2PQU0 124 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRC-204ENST00000367379 KLHL18O94889 574 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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PTPRC-204ENST00000367379 CLEC4DQ8WXI8 215 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 NUDT11Q96G61 164 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 JAM3Q9BX67 310 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRC-204ENST00000367379 SLC27A2O14975 620 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRC-204ENST00000367379 ACVRL1P37023 503 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF747Q9BV97 191 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRC-204ENST00000367379 AGRPO00253 132 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 KNG1P01042 644 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 SELENOPP49908 381 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 VASNQ6EMK4 673 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 IER2Q9BTL4 223 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 JADE2Q9NQC1 790 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-204ENST00000367379 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 SUV39H1O43463 412 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 Q6ZUG5 572 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 AJUBAQ96IF1 538 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 ASXL2Q76L83 1435 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF623O75123 536 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 SLPIP03973 132 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 FAHP16930 419 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 GDF5P43026 501 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 GRIN1Q05586 938 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 PHF19Q5T6S3 580 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 Q8TCH9 128 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-204ENST00000367379 DEF6Q9H4E7 631 aa7.51□□□□□ -1.21
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