RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 STPG3Q8N7X2 389 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 WDR26Q9H7D7 661 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 FBXO21O94952 628 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 GLRBP48167 497 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 CYP4F22Q6NT55 531 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA32Q96LK8 384 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 BCL11AQ9H165 835 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 SLC27A2O14975 620 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 IL18BPO95998 194 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 ITGAVP06756 1048 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 DUSP8Q13202 625 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 RNF151Q2KHN1 245 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 AGAP2Q99490 1192 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 RAC3P60763 192 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM48Q8IWZ4 208 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 C1orf159Q96HA4 380 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 MAFKO60675 156 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 FAHP16930 419 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 ACRV1P26436 265 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 GFRA1P56159 465 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 GPRASP2Q96D09 838 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 ZG16BQ96DA0 208 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 DPYSL5Q9BPU6 564 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 H0Y858 1186 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 KRIT1O00522 736 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 CPP00450 1065 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 CR2P20023 1033 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 NCAPHQ15003 741 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF627Q7L945 461 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 JAM3Q9BX67 310 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 MATN2O00339 956 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 LTFP02788 710 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 PFKPQ01813 784 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 TUBA3CQ13748 450 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 CD276Q5ZPR3 534 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 OR14A2Q96R54 314 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 ADH4P08319 380 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 KCNJ6P48051 423 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 FAM89AQ96GI7 184 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC140Q96MF4 163 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 TELO2Q9Y4R8 837 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF839A8K0R7 811 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 PPFIA2O75334 1257 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 TUSC3Q13454 348 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 PLA2G12BQ9BX93 195 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-202ENST00000367364 MSCO60682 206 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 CDC14BO60729 498 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 CAPNS1P04632 268 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 POLD1P28340 1107 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 VOPP1Q96AW1 172 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 KRT4P19013 534 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 SV2CQ496J9 727 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 Q6ZPA2 131 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 GJA8P48165 433 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 RRADP55042 308 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 COL10A1Q03692 680 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 FOXL1Q12952 345 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-202ENST00000367364 CEP72Q9P209 647 aa7.06□□□□□ -1.28
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