RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 KCNMA1Q12791 1236 aa23.77■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 MFN1Q8IWA4 741 aa23.77■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 FAM89AQ96GI7 184 aa23.77■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD27Q96NW4 1050 aa23.77■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.77■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.77■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 ECT2Q9H8V3 914 aa23.77■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 STXBP3O00186 592 aa23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 CEP104O60308 925 aa23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 HOOK3Q86VS8 718 aa23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 FAM167BQ9BTA0 163 aa23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 PACSIN1Q9BY11 444 aa23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 ARHGEF3Q9NR81 526 aa23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 AMACRQ9UHK6 382 aa23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 CCDC188H7C350 402 aa23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 TEX9Q8N6V9 391 aa23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D5Q92609 795 aa23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 PGM2Q96G03 612 aa23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 ADAM22Q9P0K1 906 aa23.76■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 CYP27B1O15528 508 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 EVI5O60447 810 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 SNX3O60493 162 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 PDE8BO95263 885 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 ASIC1P78348 528 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 SPATA5Q8NB90 893 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 HPS3Q969F9 1004 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 A0A087X0T9 212 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 OAS1P00973 400 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 FAM228BP0C875 321 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 CALM1P0DP23 149 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 CALM2P0DP24 149 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 CALM3P0DP25 149 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 BNIP1Q12981 228 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 SFMBT2Q5VUG0 894 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 EPB41L4BQ9H329 900 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.75■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 FLT1P17948 1338 aa23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 PLCG1P19174 1290 aa23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 KLHL29Q96CT2 875 aa23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 SELENOSQ9BQE4 189 aa23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 CEP72Q9P209 647 aa23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 SMIM22K7EJ46 135 aa23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 NOL4O94818 638 aa23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 NUDT17P0C025 328 aa23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 CABP4P57796 275 aa23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa23.74■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 DPPA5A6NC42 116 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 BTNL10A8MVZ5 291 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 SHBGP04278 402 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 MSH2P43246 934 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 FAM114A2Q9NRY5 505 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 BCORQ6W2J9 1755 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 MEGF6O75095 1541 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 TTI1O43156 1089 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 VIMP08670 466 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 ITGA4P13612 1032 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 COPS2P61201 443 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 TAF11Q15544 211 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 TSC22D3Q99576 134 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 RAB17Q9H0T7 212 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa23.73■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 KRIT1O00522 736 aa23.72■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 ASRGL1Q7L266 308 aa23.72■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 KIF2BQ8N4N8 673 aa23.72■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 METTL13Q8N6R0 699 aa23.72■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 DDAH1O94760 285 aa23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms