RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360286.2

SUDS3-201, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

TSL 5

Gene SUDS3, Length 510 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-201ENST00000360286 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 LRCH2Q5VUJ6 765 aa7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 ABHD15Q6UXT9 468 aa7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 KAT2BQ92831 832 aa7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 MTMR9Q96QG7 549 aa7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 PCYT2Q99447 389 aa7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 C16orf70Q9BSU1 422 aa7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 UNC45AQ9H3U1 944 aa7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.26□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 TBX3O15119 743 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 NEMFO60524 1076 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 KPNA6O60684 536 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 GAS7O60861 476 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 ATG7O95352 703 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 LGALS2P05162 132 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 ATXN8OSP0DMR3 200 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 TECP42680 631 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 TRAPPC10P48553 1259 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 RGS19P49795 217 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 PSEN2P49810 448 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 CDK7P50613 346 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 PTGDRQ13258 359 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 IL17AQ16552 155 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 LRRC26Q2I0M4 334 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 RILPL1Q5EBL4 403 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 NCAPH2Q6IBW4 605 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 SWSAP1Q6NVH7 229 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 B3GNT9Q6UX72 402 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 BRAPQ7Z569 592 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 TRIM50Q86XT4 487 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 FAM20AQ96MK3 541 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 GLT1D1Q96MS3 346 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 RIT2Q99578 217 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 RNPEPQ9H4A4 650 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 VAV3Q9UKW4 847 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 SAMM50Q9Y512 469 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 CLIC4Q9Y696 253 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 WDR81Q562E7 1941 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 ELP1O95163 1332 aa7.25□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 KAT6AQ92794 2004 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 H3BRB1 525 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 ARVCFO00192 962 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 HAS3O00219 553 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 LGR5O75473 907 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 CABYRO75952 493 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 BRD1O95696 1058 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 F13A1P00488 732 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 PSAPP07602 524 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 OR52Z1P0C646 297 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 ATP4AP20648 1035 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 MARK3P27448 753 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 STAT5BP51692 787 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 KRT76Q01546 638 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 ITGA7Q13683 1181 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 HIC1Q14526 733 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 MFSD10Q14728 455 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 KIAA0753Q2KHM9 967 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 GLG1Q92896 1179 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 USP28Q96RU2 1077 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 ZNF302Q9NR11 478 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 DISC1Q9NRI5 854 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 PCDHA12Q9UN75 941 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SUDS3-201ENST00000360286 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms