RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC41Q15345 812 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 ZSCAN26Q16670 478 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 JDP2Q8WYK2 163 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 VPS18Q9P253 973 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 MYH10P35580 1976 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 BMP3P12645 472 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 HYIQ5T013 277 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 BAP1Q92560 729 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 CENPFP49454 3210 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF185O15231 689 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 MCM3P25205 808 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 LMAN1P49257 510 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF11P52732 1056 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 MKL1Q969V6 931 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 SH2D4AQ9H788 454 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 COASYQ13057 564 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 DLK2Q6UY11 383 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM58Q8NG06 486 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 TSG101Q99816 390 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 RASA3Q14644 834 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC53A6NM62 1247 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 RRAGAQ7L523 313 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM71BQ8TC56 605 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM151AQ8WW52 585 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 JADE2Q9NQC1 790 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 MEIS2O14770 477 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO41Q8TF61 875 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 SNX12Q9UMY4 172 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 POLD1P28340 1107 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 ACTN2P35609 894 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNMA1Q12791 1236 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 TACC1O75410 805 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 PRR16Q569H4 304 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 PANK4Q9NVE7 773 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 CFBP00751 764 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 PRLRP16471 622 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 CREG2Q8IUH2 290 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 DCAF4Q8WV16 495 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 MED4Q9NPJ6 270 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-201ENST00000357436 OPLAHO14841 1288 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 PDXDC1Q6P996 788 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO11Q86XK2 927 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 CAGE1Q8TC20 777 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 ANO3Q9BYT9 981 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 DEF6Q9H4E7 631 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 PJA2O43164 708 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 AKR1B10O60218 316 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP9Q49MG5 647 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 MOCS3O95396 460 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 CAPN2P17655 700 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKG1Q13976 671 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 HGSNATQ68CP4 663 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-201ENST00000357436 MICALL2Q8IY33 904 aa20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms