RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 USP17L15C9J2P7 530 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 USP17L13C9JLJ4 530 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 USP17L11C9JVI0 530 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 USP17L18D6R9N7 530 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 USP17L22D6RA61 530 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 USP17L17D6RBQ6 530 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 USP17L19D6RCP7 530 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 USP17L20D6RJB6 530 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 STXBP3O00186 592 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 USP17L24Q0WX57 530 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 SBK1Q52WX2 424 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 TBC1D9BQ66K14 1250 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 USP17L6PQ6QN14 398 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 AMNQ9BXJ7 453 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 TRIM7Q9C029 511 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 BHMT2Q9H2M3 363 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 STK38LQ9Y2H1 464 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC188H7C350 402 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 CAMTA2O94983 1202 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 DOK7Q18PE1 504 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 MMGT1Q8N4V1 131 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 VEZTQ9HBM0 779 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 SFI1A8K8P3 1242 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 ABL1P00519 1130 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 CORO7P57737 925 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 BIRC3Q13489 604 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 TBC1D31Q96DN5 1066 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 EDEM3Q9BZQ6 932 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 AKAP12Q02952 1782 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 ICA1Q05084 483 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 PPM1KQ8N3J5 372 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 VGLL2Q8N8G2 317 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 NTSR2O95665 410 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 STX2P32856 288 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 ATP11AP98196 1134 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 ZIM3Q96PE6 472 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 GAS8O95995 478 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 TCP11Q8WWU5 503 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 SPZ1Q9BXG8 430 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 LCMT1Q9UIC8 334 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 ALDH3A1P30838 453 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 FBXW10Q5XX13 1052 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 FOXR1Q6PIV2 292 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 KBTBD4Q9NVX7 518 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 A0A1W2PQJ5 194 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 PPP1R37O75864 691 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 NLRP14Q86W24 1093 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 KIAA0825Q8IV33 1275 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 NEDD1Q8NHV4 660 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 ANO3Q9BYT9 981 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM51Q9NW97 253 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 USTQ9Y2C2 406 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 LRRC10BA6NIK2 292 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 DR1Q01658 176 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 SFR1Q86XK3 245 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC63Q8NA47 563 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 GRID2IPA4D2P6 1211 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 K7ENM7 598 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 MYL7Q01449 175 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 NEK9Q8TD19 979 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC127Q96BQ5 260 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 TCHPQ9BT92 498 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 PIK3C2AO00443 1686 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 FOSP01100 380 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 SMTNP53814 917 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 SLC18A3Q16572 532 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 UBXN2AP68543 259 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 OGFOD1Q8N543 542 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 IMPG2Q9BZV3 1241 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRU-201ENST00000345512 POTEFA5A3E0 1075 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 POTEIP0CG38 1075 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 POTEGQ6S5H5 508 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 POTEEQ6S8J3 1075 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 FNBP1Q96RU3 617 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 AMACRQ9UHK6 382 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 SNX24Q9Y343 169 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 GMNCA6NCL1 334 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 KLRC1P26715 233 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 KLRK1P26718 216 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 GRAPQ13588 217 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms