RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 MYH4Q9Y623 1939 aa24.81■■□□□ 1.56
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HOXD1-201ENST00000331462 POTECB2RU33 542 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM66O15016 1216 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 SLC12A3P55017 1021 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 POTEBQ6S5H4 581 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 MREGQ8N565 214 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D5Q92609 795 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 GJA10Q969M2 543 aa24.81■■□□□ 1.56
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HOXD1-201ENST00000331462 EHD4Q9H223 541 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 KLRC1P26715 233 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 APBA1Q02410 837 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.8■■□□□ 1.56
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HOXD1-201ENST00000331462 CRYGNQ8WXF5 182 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 PLCB1Q9NQ66 1216 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 A0A087X0T9 212 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 C6orf229H3BNL8 230 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 FAM228BP0C875 321 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 SLC16A2P36021 539 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 ASIC2Q16515 512 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa24.8■■□□□ 1.56
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HOXD1-201ENST00000331462 C10orf67Q8IYJ2 551 aa24.8■■□□□ 1.56
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HOXD1-201ENST00000331462 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa24.8■■□□□ 1.56
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HOXD1-201ENST00000331462 CORO7P57737 925 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 SKOR1P84550 965 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 KLHL30Q0D2K2 578 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 PAK2Q13177 524 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 AP3B2Q13367 1082 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 RAPGEF1Q13905 1077 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 ARSHQ5FYA8 562 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 MS4A14Q96JA4 679 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC17Q96LX7 622 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D7Q9P0N9 293 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 A6NNZ2 444 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 ADAM9Q13443 819 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 TUBB8Q3ZCM7 444 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 MCTP2Q6DN12 878 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 KCTD1Q719H9 257 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 FRMD5Q7Z6J6 570 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 CERS5Q8N5B7 392 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 TBX3O15119 743 aa24.78■■□□□ 1.56
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HOXD1-201ENST00000331462 MAGEA9P43362 315 aa24.77■■□□□ 1.56
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HOXD1-201ENST00000331462 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
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HOXD1-201ENST00000331462 DCAF4Q8WV16 495 aa24.77■■□□□ 1.56
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HOXD1-201ENST00000331462 USP40Q9NVE5 1235 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 GRIN2DO15399 1336 aa24.77■■□□□ 1.56
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HOXD1-201ENST00000331462 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.76■■□□□ 1.55
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HOXD1-201ENST00000331462 MKL1Q969V6 931 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD1-201ENST00000331462 RUFY1Q96T51 708 aa24.76■■□□□ 1.55
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HOXD1-201ENST00000331462 USP17L15C9J2P7 530 aa24.76■■□□□ 1.55
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HOXD1-201ENST00000331462 USP17L11C9JVI0 530 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD1-201ENST00000331462 USP17L18D6R9N7 530 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD1-201ENST00000331462 USP17L22D6RA61 530 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD1-201ENST00000331462 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD1-201ENST00000331462 USP17L19D6RCP7 530 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD1-201ENST00000331462 USP17L20D6RJB6 530 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD1-201ENST00000331462 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
HOXD1-201ENST00000331462 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXD1-201ENST00000331462 FTCDO95954 541 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD1-201ENST00000331462 MYBP10242 640 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD1-201ENST00000331462 NR2F2P24468 414 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD1-201ENST00000331462 EPS15P42566 896 aa24.76■■□□□ 1.55
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