RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321556.4

PINK1-201, Transcript of PTEN induced putative kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PINK1, Length 2,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1-201ENST00000321556 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa26.05■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 GOLGA6CA6NDK9 693 aa26.04■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 GLI1P08151 1106 aa26.04■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 GOLGA6DP0CG33 693 aa26.04■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 CYP11B2P19099 503 aa26.04■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.04■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 IFT81Q8WYA0 676 aa26.04■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 IQCDQ96DY2 449 aa26.04■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.04■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa26.04■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 STIM2Q9P246 746 aa26.04■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 PPARDQ03181 441 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 TRIM59Q8IWR1 403 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 ABCB11O95342 1321 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 BBOX1O75936 387 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 FAM153BP0C7A2 387 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 SLC9A1P19634 815 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 CARSP49589 748 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 KIAA0753Q2KHM9 967 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 FAM153CQ494X1 144 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 USH1GQ495M9 461 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 CCDC65Q8IXS2 484 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 PROM2Q8N271 834 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 ARL8AQ96BM9 186 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 IKZF4Q9H2S9 585 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 KCTD10Q9H3F6 313 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 FAM153AQ9UHL3 310 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.03■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 SERPING1P05155 500 aa26.02■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 IVLP07476 585 aa26.02■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 PRLRP16471 622 aa26.02■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 EPS15P42566 896 aa26.02■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 PRR16Q569H4 304 aa26.02■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 LRRC27Q9C0I9 530 aa26.02■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 FOCADQ5VW36 1801 aa26.02■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 KLHL30Q0D2K2 578 aa26.02■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 FAM76AQ8TAV0 307 aa26.02■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 DNAJC18Q9H819 358 aa26.02■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 NFU1Q9UMS0 254 aa26.02■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa26.01■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 VGLL3A8MV65 326 aa26.01■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 KCNH2Q12809 1159 aa26.01■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 ANO3Q9BYT9 981 aa26.01■■□□□ 1.76
PINK1-201ENST00000321556 NR2F2P24468 414 aa26.01■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 CYP4A11Q02928 519 aa26.01■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 KCTD16Q68DU8 428 aa26.01■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 GUCY2FP51841 1108 aa26.01■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 GUCY2DQ02846 1103 aa26.01■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 KRT12Q99456 494 aa26.01■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 EPB41L5Q9HCM4 733 aa26.01■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 SMCHD1A6NHR9 2005 aa26■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 RSPH10B2B2RC85 870 aa26■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 RSPH10BP0C881 870 aa26■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 EEF2P13639 858 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 CATSPER3Q86XQ3 398 aa26■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 SH2D3CQ8N5H7 860 aa26■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 NT5C3AQ9H0P0 336 aa26■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 RPS6KA5O75582 802 aa25.99■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 CFAP221Q4G0U5 840 aa25.99■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 SFI1A8K8P3 1242 aa25.99■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 KRT14P02533 472 aa25.99■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.99■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.99■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 MYBP10242 640 aa25.98■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 PTK2Q05397 1052 aa25.98■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 KCNA1Q09470 495 aa25.98■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 NAB2Q15742 525 aa25.98■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 SLC18A3Q16572 532 aa25.98■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 TTMPQ5BVD1 217 aa25.98■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 SFR1Q86XK3 245 aa25.98■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa25.98■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 SLC12A3P55017 1021 aa25.98■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 ASIC2Q16515 512 aa25.98■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 KLHL7Q8IXQ5 586 aa25.98■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 GANQ9H2C0 597 aa25.98■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 KCNMB3Q9NPA1 279 aa25.98■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.98■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 HOXD13P35453 343 aa25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 EPHB4P54760 987 aa25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 TCERG1LQ5VWI1 586 aa25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 GJB7Q6PEY0 223 aa25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 CEP63Q96MT8 703 aa25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 ZIM3Q96PE6 472 aa25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 RASSF4Q9H2L5 321 aa25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 MEIS2O14770 477 aa25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms